278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6086 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6086  amidase  100 
 
 		 421 aa  846    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3330  amidase, hydantoinase/carbamoylase  54.68 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  44.69 
 
 		 418 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  44.18 
 
 		 418 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  45.48 
 
 		 431 aa  299  7e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  45.61 
 
 		 418 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  45.16 
 
 		 420 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  45.16 
 
 		 420 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  45.61 
 
 		 418 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  45.61 
 
 		 418 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  44.72 
 
 		 421 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  46.04 
 
 		 429 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  44.67 
 
 		 419 aa  293  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  42.57 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  45.41 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  45.05 
 
 		 418 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  45.41 
 
 		 523 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  42.75 
 
 		 408 aa  290  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1546  allantoate amidohydrolase  45.91 
 
 		 414 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  42.48 
 
 		 420 aa  289  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  43.28 
 
 		 414 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  43.48 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  43.14 
 
 		 426 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  43.14 
 
 		 426 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  44.2 
 
 		 423 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  40.24 
 
 		 431 aa  286  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  42.13 
 
 		 426 aa  285  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.86 
 
 		 418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  41.36 
 
 		 416 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  42.2 
 
 		 423 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  41.79 
 
 		 414 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  41.85 
 
 		 425 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  42.27 
 
 		 426 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  41.83 
 
 		 420 aa  281  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5235  allantoate amidohydrolase  42.93 
 
 		 407 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  42.48 
 
 		 426 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  42.48 
 
 		 426 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.33 
 
 		 412 aa  279  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  42.69 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  41.79 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  39.86 
 
 		 422 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  41.89 
 
 		 426 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  43.93 
 
 		 418 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  41.27 
 
 		 427 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  42.23 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  42.21 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  42.93 
 
 		 415 aa  276  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  40.2 
 
 		 421 aa  276  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  43.56 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  43.56 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  40.61 
 
 		 421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  40.83 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  42.68 
 
 		 415 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  42.36 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  42.36 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.95 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  41.3 
 
 		 427 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  44.07 
 
 		 423 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  43.99 
 
 		 423 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  41.32 
 
 		 427 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  41.41 
 
 		 427 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.69 
 
 		 418 aa  272  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  40.25 
 
 		 418 aa  272  9e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  43.07 
 
 		 407 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  40.63 
 
 		 415 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  40.63 
 
 		 431 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  43.32 
 
 		 407 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  38.59 
 
 		 423 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  40.63 
 
 		 415 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  41.97 
 
 		 412 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  43.26 
 
 		 423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  41.23 
 
 		 427 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  42.4 
 
 		 427 aa  269  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  42.36 
 
 		 421 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  41.03 
 
 		 413 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  40.39 
 
 		 416 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  42.01 
 
 		 415 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  38.97 
 
 		 424 aa  262  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.55 
 
 		 421 aa  261  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  41.93 
 
 		 479 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  40.2 
 
 		 425 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  39.95 
 
 		 425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  39.95 
 
 		 425 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  37.2 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  41.2 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  41.2 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  41.2 
 
 		 471 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.12 
 
 		 430 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  38.12 
 
 		 411 aa  257  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1186  amidase, hydantoinase/carbamoylase  40.63 
 
 		 412 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  40.64 
 
 		 423 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.41 
 
 		 412 aa  253  7e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  40.96 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1266  allantoate amidohydrolase  40.96 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  40.96 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  40.96 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  39.12 
 
 		 409 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  40.8 
 
 		 424 aa  249  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.61 
 
 		 422 aa  249  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  41.77 
 
 		 420 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>