281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3330 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3330  amidase, hydantoinase/carbamoylase  100 
 
 		 436 aa  895    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  54.68 
 
 		 421 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  42.58 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  41.45 
 
 		 427 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42 
 
 		 420 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42 
 
 		 420 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.41 
 
 		 428 aa  286  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  42.13 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  39.91 
 
 		 424 aa  283  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  42.76 
 
 		 419 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  43 
 
 		 426 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  41.5 
 
 		 425 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  43.14 
 
 		 418 aa  279  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  41.49 
 
 		 420 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  39.09 
 
 		 411 aa  278  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  41.35 
 
 		 421 aa  277  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  41.25 
 
 		 420 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  40.95 
 
 		 427 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  42.51 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  41.16 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  41.71 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  40 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  42.65 
 
 		 431 aa  275  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  41.19 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  41.46 
 
 		 426 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  42.27 
 
 		 426 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  42.27 
 
 		 426 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  43.07 
 
 		 429 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  39.71 
 
 		 416 aa  273  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  40.68 
 
 		 426 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  42.82 
 
 		 429 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  42.82 
 
 		 523 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  40.44 
 
 		 418 aa  272  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  39.13 
 
 		 411 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  40.19 
 
 		 427 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  40.98 
 
 		 418 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  41.16 
 
 		 423 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  40.98 
 
 		 418 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  42.33 
 
 		 423 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  40.98 
 
 		 418 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.13 
 
 		 430 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  40.95 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  39.91 
 
 		 421 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  40.73 
 
 		 418 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  39.76 
 
 		 427 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  41.25 
 
 		 408 aa  269  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  40.89 
 
 		 418 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  42.4 
 
 		 423 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  41.83 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  39.53 
 
 		 421 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  42.62 
 
 		 479 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  41.36 
 
 		 426 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.75 
 
 		 426 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  39.86 
 
 		 425 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  40.89 
 
 		 471 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  40.1 
 
 		 413 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  40.89 
 
 		 459 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  40.89 
 
 		 459 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  39.08 
 
 		 412 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  38.5 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5235  allantoate amidohydrolase  41.57 
 
 		 407 aa  265  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  39.38 
 
 		 425 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  40 
 
 		 416 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  40.83 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  40.83 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  39.38 
 
 		 425 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  40.67 
 
 		 418 aa  262  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  40.32 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  40.32 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1266  allantoate amidohydrolase  40.32 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  40.32 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  41.42 
 
 		 423 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.23 
 
 		 412 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.71 
 
 		 418 aa  259  8e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  40.83 
 
 		 415 aa  259  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  39.66 
 
 		 422 aa  259  8e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  40.93 
 
 		 427 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1546  allantoate amidohydrolase  42.54 
 
 		 414 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  39.76 
 
 		 415 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  40.96 
 
 		 423 aa  257  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  40.49 
 
 		 414 aa  257  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  41.35 
 
 		 407 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  41.35 
 
 		 407 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  39.52 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  41.11 
 
 		 407 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.35 
 
 		 422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  40.79 
 
 		 407 aa  253  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  40.58 
 
 		 415 aa  253  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  39.38 
 
 		 415 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.45 
 
 		 421 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  40.38 
 
 		 415 aa  249  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2217  allantoate amidohydrolase  41.16 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1308  allantoate amidohydrolase  41.16 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0702  allantoate amidohydrolase  41.16 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2536  allantoate amidohydrolase  41.16 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2078  allantoate amidohydrolase  41.16 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0986595  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  41.16 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  37.5 
 
 		 431 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1147  allantoate amidohydrolase  41.08 
 
 		 420 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  38.57 
 
 		 416 aa  245  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>