277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2168 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2168  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  100 
 
 
394 aa  804    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.440268  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.29 
 
 
447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.66 
 
 
415 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  32.18 
 
 
409 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  31.93 
 
 
429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  32.01 
 
 
409 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 
409 aa  209  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  31.93 
 
 
428 aa  207  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  32.75 
 
 
425 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  32.51 
 
 
426 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  34.3 
 
 
422 aa  206  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  31.45 
 
 
415 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  29.88 
 
 
426 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  31.76 
 
 
427 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  31.16 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.36 
 
 
413 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  31.08 
 
 
427 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  32.35 
 
 
437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  32.03 
 
 
414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  31.51 
 
 
427 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  30.56 
 
 
422 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  31.68 
 
 
412 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  29.95 
 
 
418 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.58 
 
 
412 aa  194  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  30.93 
 
 
411 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  30.93 
 
 
411 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  32.09 
 
 
414 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  31.19 
 
 
411 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  30.93 
 
 
411 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  31.19 
 
 
411 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  30.67 
 
 
411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  30.67 
 
 
411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  30.67 
 
 
411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  29.9 
 
 
421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  31.19 
 
 
411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  30.67 
 
 
411 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  31.19 
 
 
415 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  30.93 
 
 
411 aa  189  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0531  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.92 
 
 
401 aa  188  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  29.46 
 
 
431 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  30.3 
 
 
414 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  29.9 
 
 
416 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  29.78 
 
 
417 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  33.59 
 
 
414 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  28.86 
 
 
407 aa  186  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4127  allantoate amidohydrolase  29.35 
 
 
413 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.638137  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  29.34 
 
 
431 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  30.27 
 
 
420 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  29.28 
 
 
427 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  29.77 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.93 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  31.2 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  30.58 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  29.35 
 
 
421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  29.46 
 
 
427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  29.03 
 
 
427 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1247  amidase  30.05 
 
 
408 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  28.71 
 
 
429 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  29.46 
 
 
429 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  29.21 
 
 
427 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  29.61 
 
 
426 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  29.46 
 
 
427 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  28.11 
 
 
415 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  29.4 
 
 
425 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  31.76 
 
 
411 aa  182  8.000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  29.23 
 
 
408 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  32.25 
 
 
423 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  28.72 
 
 
426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  29.55 
 
 
426 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  30 
 
 
420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3711  allantoate amidohydrolase  30.4 
 
 
400 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  30.25 
 
 
416 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.28 
 
 
420 aa  180  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0554  allantoate amidohydrolase  28.86 
 
 
413 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2555  allantoate amidohydrolase  31.14 
 
 
403 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  28.19 
 
 
412 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  28.96 
 
 
420 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  28.96 
 
 
420 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  30.24 
 
 
415 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.71 
 
 
419 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  28.25 
 
 
429 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  28.86 
 
 
418 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.19 
 
 
424 aa  177  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  28.07 
 
 
425 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  28.32 
 
 
523 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  27.82 
 
 
425 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  30.17 
 
 
415 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  28.54 
 
 
427 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  29.21 
 
 
411 aa  176  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  27.86 
 
 
416 aa  176  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  28.71 
 
 
417 aa  176  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.21 
 
 
430 aa  176  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  28.07 
 
 
425 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5235  allantoate amidohydrolase  29.41 
 
 
407 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  27.43 
 
 
428 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  29.34 
 
 
424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.56 
 
 
421 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  27.71 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  29.66 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  28.78 
 
 
419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>