274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2555 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2555  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 403 aa  796    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3711  allantoate amidohydrolase  87.22 
 
 		 400 aa  698    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1574  allantoate amidohydrolase  78.39 
 
 		 400 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.914199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7037  allantoate amidohydrolase  53.13 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4127  allantoate amidohydrolase  48.48 
 
 		 413 aa  338  8e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.638137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0554  allantoate amidohydrolase  46.67 
 
 		 413 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4610  allantoate amidohydrolase  48.21 
 
 		 414 aa  328  8e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0920058  normal  0.113681 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  36.59 
 
 		 412 aa  209  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.63 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  39.32 
 
 		 417 aa  199  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.85 
 
 		 413 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  33.83 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  32.67 
 
 		 409 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  35.82 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  31.96 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  33.9 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  37.6 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  37.53 
 
 		 421 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.05 
 
 		 412 aa  179  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3330  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.92 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  35.32 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  35.49 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.96 
 
 		 407 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  30.92 
 
 		 409 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  36.6 
 
 		 422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  36.95 
 
 		 414 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  34.07 
 
 		 414 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  35.31 
 
 		 430 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.57 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.11 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  35.6 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  35.6 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4007  allantoate amidohydrolase  36.91 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  34.72 
 
 		 411 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  30.47 
 
 		 411 aa  168  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  35.34 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  33.77 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  34.29 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  35.48 
 
 		 422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  33.59 
 
 		 411 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2168  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.14 
 
 		 394 aa  167  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.440268  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  32.34 
 
 		 416 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  32.47 
 
 		 416 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  33.59 
 
 		 411 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  33.59 
 
 		 411 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  33.59 
 
 		 411 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 411 aa  166  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 411 aa  166  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  32.91 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  32.91 
 
 		 411 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  32.91 
 
 		 411 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  32.91 
 
 		 411 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.83 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  32.28 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7813  allantoate amidohydrolase  33.77 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  37.6 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  37.6 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  33.94 
 
 		 589 aa  164  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1867  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.31 
 
 		 413 aa  164  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.608993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3752  allantoate amidohydrolase  35.21 
 
 		 441 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  33.81 
 
 		 415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  32.67 
 
 		 415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  33.16 
 
 		 421 aa  163  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 431 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  33.75 
 
 		 442 aa  162  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  34.31 
 
 		 414 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.52 
 
 		 421 aa  162  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  32.99 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  34.47 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  33.68 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  34.18 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 427 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4047  allantoate amidohydrolase  34.72 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.439433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  31.85 
 
 		 422 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  31.19 
 
 		 424 aa  160  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  35.87 
 
 		 599 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  36.15 
 
 		 429 aa  159  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  33.74 
 
 		 430 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  32.11 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.5 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5235  allantoate amidohydrolase  33.59 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  30.97 
 
 		 418 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  32.5 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.51 
 
 		 415 aa  156  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1507  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.78 
 
 		 469 aa  156  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0692764 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  34.04 
 
 		 589 aa  156  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  33.68 
 
 		 416 aa  156  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  29.77 
 
 		 425 aa  155  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2575  allantoate amidohydrolase  33.74 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124568  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1015  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.98 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4391  amidase  36.22 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.131322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  34.7 
 
 		 593 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.09 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  36.23 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.16 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  39.21 
 
 		 424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>