281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7037 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7037  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 419 aa  848    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3711  allantoate amidohydrolase  53.15 
 
 		 400 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2555  allantoate amidohydrolase  53.13 
 
 		 403 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1574  allantoate amidohydrolase  51.64 
 
 		 400 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.914199 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4610  allantoate amidohydrolase  48.39 
 
 		 414 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0920058  normal  0.113681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4127  allantoate amidohydrolase  47.09 
 
 		 413 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.638137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0554  allantoate amidohydrolase  47.74 
 
 		 413 aa  323  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  38.29 
 
 		 412 aa  229  6e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.68 
 
 		 415 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.41 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  35.82 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  33.09 
 
 		 429 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  36.63 
 
 		 417 aa  186  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  35.05 
 
 		 423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  33.9 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  32.92 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  36.99 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  33.07 
 
 		 409 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.51 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.59 
 
 		 421 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  32.84 
 
 		 431 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  35.34 
 
 		 422 aa  177  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  36.1 
 
 		 414 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  36.36 
 
 		 437 aa  176  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  32.14 
 
 		 416 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.66 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  34.73 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.66 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  32.28 
 
 		 419 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  35.44 
 
 		 421 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  34.15 
 
 		 421 aa  173  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  33.82 
 
 		 415 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  33.58 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  34.09 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  35.66 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2575  allantoate amidohydrolase  33.66 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124568  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  33.66 
 
 		 427 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.33 
 
 		 428 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  32.99 
 
 		 409 aa  170  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.36 
 
 		 407 aa  170  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 425 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  33.67 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  33.66 
 
 		 427 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  34.39 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  33.67 
 
 		 423 aa  166  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.47 
 
 		 407 aa  166  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2168  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.28 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.440268  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  34.21 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  32.93 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  31.68 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.39 
 
 		 419 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  34.89 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  31.77 
 
 		 420 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.42 
 
 		 424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.16 
 
 		 417 aa  163  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.2 
 
 		 412 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  31.86 
 
 		 415 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.37 
 
 		 418 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  32.58 
 
 		 424 aa  162  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  32.35 
 
 		 411 aa  162  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  31.92 
 
 		 414 aa  162  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0104  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0189735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  32.45 
 
 		 425 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  32.59 
 
 		 408 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  31.13 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  32.67 
 
 		 423 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1015  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.72 
 
 		 433 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  35.71 
 
 		 407 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  35.71 
 
 		 407 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3100  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.89 
 
 		 518 aa  159  9e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  34.41 
 
 		 407 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  31.96 
 
 		 415 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  32.45 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  31.43 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  33.01 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  36.71 
 
 		 424 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  31.7 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  31.7 
 
 		 421 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  33.76 
 
 		 591 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3036  allantoate amidohydrolase  31.04 
 
 		 417 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.376517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  32.23 
 
 		 589 aa  158  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.02 
 
 		 418 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  31.16 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4007  allantoate amidohydrolase  33.03 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1455  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 424 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  31.19 
 
 		 426 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  35.44 
 
 		 407 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  29.18 
 
 		 411 aa  156  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  31.72 
 
 		 420 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  31.92 
 
 		 427 aa  156  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  32.07 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  32.61 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  32.61 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  28.36 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  30.92 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.26 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1247  amidase  31.66 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>