276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4007 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3752  allantoate amidohydrolase  91.59 
 
 		 441 aa  768    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4007  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 430 aa  862    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4047  allantoate amidohydrolase  91.12 
 
 		 433 aa  765    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.439433 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7267  allantoate amidohydrolase  71.6 
 
 		 411 aa  580  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2595  allantoate amidohydrolase  67.84 
 
 		 428 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0104  allantoate amidohydrolase  53.75 
 
 		 424 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0189735 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1455  allantoate amidohydrolase  53.51 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3190  peptidase, M20/M25/M40 family  45.04 
 
 		 426 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3056  allantoate amidohydrolase  44.94 
 
 		 426 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123515  normal  0.691703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0043  allantoate amidohydrolase  44.17 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1015  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.34 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  38.72 
 
 		 424 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  39.9 
 
 		 408 aa  265  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  37.66 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  37.35 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  39.45 
 
 		 418 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  39.21 
 
 		 418 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  38.96 
 
 		 418 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  38.96 
 
 		 418 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  38.96 
 
 		 418 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  38.71 
 
 		 421 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  36.14 
 
 		 431 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  37.53 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.48 
 
 		 421 aa  247  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  36.43 
 
 		 416 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.53 
 
 		 426 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.14 
 
 		 428 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.84 
 
 		 418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  37.35 
 
 		 415 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.28 
 
 		 426 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.92 
 
 		 407 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  38.86 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  38.86 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1113  allantoate amidohydrolase  38.15 
 
 		 416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  37.9 
 
 		 429 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  38.8 
 
 		 414 aa  240  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.67 
 
 		 418 aa  239  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.18 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  38.41 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  38 
 
 		 431 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  38.61 
 
 		 423 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 		 423 aa  237  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.28 
 
 		 415 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  35.89 
 
 		 411 aa  236  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.23 
 
 		 420 aa  236  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  36.54 
 
 		 423 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.23 
 
 		 420 aa  236  8e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  36.03 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  36.82 
 
 		 427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  36.54 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  37.65 
 
 		 415 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.3 
 
 		 415 aa  234  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  35.49 
 
 		 422 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  37.65 
 
 		 429 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  37.41 
 
 		 423 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  37.56 
 
 		 413 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.41 
 
 		 523 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  35.7 
 
 		 426 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  36.96 
 
 		 442 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  37.77 
 
 		 414 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  37 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  37.86 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  37.07 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1247  amidase  35.61 
 
 		 408 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7813  allantoate amidohydrolase  36.89 
 
 		 415 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  35.29 
 
 		 414 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  36.14 
 
 		 415 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  34.15 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  36.34 
 
 		 426 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1546  allantoate amidohydrolase  38.83 
 
 		 414 aa  229  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1186  amidase, hydantoinase/carbamoylase  40.58 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  35.97 
 
 		 418 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  36.12 
 
 		 426 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  37.12 
 
 		 415 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  35.14 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  36.34 
 
 		 426 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  36.34 
 
 		 426 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  37.2 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  35.38 
 
 		 426 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  35.87 
 
 		 420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  37.41 
 
 		 407 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  37.41 
 
 		 407 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  36.75 
 
 		 423 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1461  allantoate amidohydrolase  38.02 
 
 		 419 aa  226  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  36.71 
 
 		 426 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.36 
 
 		 412 aa  226  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  36.48 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0184  allantoate amidohydrolase  38.42 
 
 		 419 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519894  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  35.85 
 
 		 426 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1817  allantoate amidohydrolase  38.42 
 
 		 419 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.545008  normal  0.138716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  38.89 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  34.05 
 
 		 418 aa  224  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  34.15 
 
 		 421 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0348  allantoate amidohydrolase  34.32 
 
 		 415 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  37.16 
 
 		 407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  36.14 
 
 		 427 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  36.23 
 
 		 427 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  36.75 
 
 		 427 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3455  allantoate amidohydrolase  34.81 
 
 		 409 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423786  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  35.98 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>