276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3056 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3190  peptidase, M20/M25/M40 family  88.71 
 
 		 426 aa  748    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3056  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 426 aa  865    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123515  normal  0.691703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0043  allantoate amidohydrolase  63.38 
 
 		 430 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4047  allantoate amidohydrolase  44.39 
 
 		 433 aa  328  9e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.439433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3752  allantoate amidohydrolase  44.6 
 
 		 441 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4007  allantoate amidohydrolase  44.94 
 
 		 430 aa  322  8e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1015  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  47 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7267  allantoate amidohydrolase  41.62 
 
 		 411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2595  allantoate amidohydrolase  41.46 
 
 		 428 aa  296  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0104  allantoate amidohydrolase  40.59 
 
 		 424 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0189735 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1455  allantoate amidohydrolase  40.29 
 
 		 424 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  40 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.75 
 
 		 426 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7813  allantoate amidohydrolase  39.95 
 
 		 415 aa  269  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  40.51 
 
 		 419 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1247  amidase  39.47 
 
 		 408 aa  259  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  39.95 
 
 		 429 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.3 
 
 		 421 aa  256  7e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  40.16 
 
 		 431 aa  255  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  39.39 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.91 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  39.39 
 
 		 523 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  38.07 
 
 		 420 aa  252  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  37.31 
 
 		 418 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  36.67 
 
 		 416 aa  249  8e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  39.95 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.82 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  37.37 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  35.92 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  38.66 
 
 		 427 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.63 
 
 		 420 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.63 
 
 		 420 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  37.56 
 
 		 418 aa  246  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  36.08 
 
 		 423 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  38.4 
 
 		 427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.05 
 
 		 418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  40.46 
 
 		 412 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  38.48 
 
 		 415 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  35.64 
 
 		 416 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  36.34 
 
 		 426 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  38.14 
 
 		 415 aa  240  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.53 
 
 		 428 aa  239  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  40.2 
 
 		 413 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  38.4 
 
 		 424 aa  239  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  38.4 
 
 		 427 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  36.18 
 
 		 411 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  36.09 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  38.66 
 
 		 427 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  35.59 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  36.25 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  35.75 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  38.4 
 
 		 427 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  38.66 
 
 		 427 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  35.43 
 
 		 431 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  39.32 
 
 		 423 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  36.39 
 
 		 421 aa  235  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  36.08 
 
 		 422 aa  235  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  38.36 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  35.75 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  36.41 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  35.64 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1367  allantoate amidohydrolase  35.36 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  38.54 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  38.36 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  38.54 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  38.36 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  36 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  38.38 
 
 		 421 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  38.27 
 
 		 423 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  36 
 
 		 426 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  36 
 
 		 426 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  38.65 
 
 		 421 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.41 
 
 		 407 aa  233  7.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  39.32 
 
 		 423 aa  232  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1113  allantoate amidohydrolase  36.6 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.28 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  35.92 
 
 		 415 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  39.32 
 
 		 423 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  37.08 
 
 		 411 aa  229  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  36.28 
 
 		 418 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0348  allantoate amidohydrolase  35.28 
 
 		 415 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  37.83 
 
 		 418 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1498  allantoate amidohydrolase  35.2 
 
 		 416 aa  227  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  36.59 
 
 		 425 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  35.81 
 
 		 415 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1546  allantoate amidohydrolase  38.85 
 
 		 414 aa  226  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  36.52 
 
 		 420 aa  226  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  37.76 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2707  allantoate amidohydrolase  34.3 
 
 		 420 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158107  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  36.09 
 
 		 425 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  37.04 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  35.84 
 
 		 425 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  37.28 
 
 		 421 aa  221  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3455  allantoate amidohydrolase  35.73 
 
 		 409 aa  220  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423786  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.05 
 
 		 422 aa  219  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_004310  BR0279  allantoate amidohydrolase  34.56 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  35.32 
 
 		 414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  35.77 
 
 		 428 aa  217  4e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  36.87 
 
 		 407 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  36.87 
 
 		 407 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>