283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0043 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0043  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 430 aa  871    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3056  allantoate amidohydrolase  63.38 
 
 		 426 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123515  normal  0.691703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3190  peptidase, M20/M25/M40 family  62.8 
 
 		 426 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4047  allantoate amidohydrolase  44.8 
 
 		 433 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.439433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3752  allantoate amidohydrolase  44.55 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4007  allantoate amidohydrolase  44.06 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1015  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.23 
 
 		 433 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7267  allantoate amidohydrolase  41.01 
 
 		 411 aa  289  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2595  allantoate amidohydrolase  39.86 
 
 		 428 aa  275  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0104  allantoate amidohydrolase  39.5 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0189735 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1455  allantoate amidohydrolase  39.5 
 
 		 424 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  41.78 
 
 		 408 aa  259  8e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  39.65 
 
 		 429 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  38.72 
 
 		 427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.2 
 
 		 426 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  38.9 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  39.43 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1247  amidase  40.11 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  36.86 
 
 		 423 aa  250  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  40.1 
 
 		 413 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  39.15 
 
 		 426 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  38.64 
 
 		 419 aa  249  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  39.18 
 
 		 427 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  39.15 
 
 		 429 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  39.15 
 
 		 523 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  38.85 
 
 		 427 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.05 
 
 		 412 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  37.97 
 
 		 426 aa  245  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  37.26 
 
 		 426 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  35.98 
 
 		 420 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  36.97 
 
 		 421 aa  244  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  36.71 
 
 		 418 aa  243  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  38.35 
 
 		 427 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  36.29 
 
 		 411 aa  243  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.53 
 
 		 421 aa  243  6e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.35 
 
 		 428 aa  243  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  38.6 
 
 		 427 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  38.46 
 
 		 418 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  39.46 
 
 		 423 aa  240  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  38.56 
 
 		 418 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  38.56 
 
 		 418 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  38.11 
 
 		 412 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  38.1 
 
 		 427 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  36.72 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.86 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  37.89 
 
 		 418 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  35.93 
 
 		 421 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  38.64 
 
 		 427 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  37.18 
 
 		 418 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  38.65 
 
 		 418 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  37.6 
 
 		 421 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.85 
 
 		 415 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  36.92 
 
 		 418 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7813  allantoate amidohydrolase  38.12 
 
 		 415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  34.28 
 
 		 416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0531  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.83 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  37.32 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  37.56 
 
 		 437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  36.9 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  38.64 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  38.9 
 
 		 423 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  36.93 
 
 		 426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  36.9 
 
 		 414 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.68 
 
 		 420 aa  232  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.68 
 
 		 420 aa  232  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  37.07 
 
 		 426 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  36.83 
 
 		 426 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  38.12 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  38.12 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  36.83 
 
 		 426 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  36.83 
 
 		 426 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1498  allantoate amidohydrolase  35.53 
 
 		 416 aa  229  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  36.83 
 
 		 426 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0348  allantoate amidohydrolase  36.58 
 
 		 415 aa  229  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  35.38 
 
 		 415 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  35.79 
 
 		 420 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.24 
 
 		 407 aa  229  8e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1546  allantoate amidohydrolase  40.81 
 
 		 414 aa  229  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  38.9 
 
 		 423 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5235  allantoate amidohydrolase  37.59 
 
 		 407 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0293  allantoate amidohydrolase  35.94 
 
 		 415 aa  227  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0374467  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  37.6 
 
 		 423 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_004310  BR0279  allantoate amidohydrolase  35.94 
 
 		 415 aa  227  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  37 
 
 		 415 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  38.19 
 
 		 407 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  38.19 
 
 		 407 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.87 
 
 		 415 aa  226  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1113  allantoate amidohydrolase  36.83 
 
 		 416 aa  226  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1367  allantoate amidohydrolase  36.05 
 
 		 424 aa  225  9e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  35.22 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  35.22 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2707  allantoate amidohydrolase  34.33 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158107  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  34.63 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  37.94 
 
 		 407 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  35.68 
 
 		 425 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  37.59 
 
 		 407 aa  223  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  36.55 
 
 		 415 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  36.17 
 
 		 414 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  35.4 
 
 		 422 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>