277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1574 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1574  allantoate amidohydrolase  100 
 
 
400 aa  796    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.914199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3711  allantoate amidohydrolase  82.46 
 
 
400 aa  666    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2555  allantoate amidohydrolase  78.39 
 
 
403 aa  627  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7037  allantoate amidohydrolase  51.64 
 
 
419 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4610  allantoate amidohydrolase  48.72 
 
 
414 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0920058  normal  0.113681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4127  allantoate amidohydrolase  46.6 
 
 
413 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.638137  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0554  allantoate amidohydrolase  46.35 
 
 
413 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  36.87 
 
 
412 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.35 
 
 
413 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.37 
 
 
415 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  35.21 
 
 
409 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  34.54 
 
 
429 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  34.92 
 
 
409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.57 
 
 
447 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  37.86 
 
 
417 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  35.29 
 
 
415 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  31.36 
 
 
409 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  35.25 
 
 
423 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  38.12 
 
 
414 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  35.85 
 
 
433 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  35.52 
 
 
422 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.02 
 
 
412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  36.3 
 
 
421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  33.75 
 
 
429 aa  172  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  34.92 
 
 
589 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  34.66 
 
 
415 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  35.45 
 
 
414 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.94 
 
 
419 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  34.23 
 
 
407 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  34.23 
 
 
407 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  34.65 
 
 
411 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  36.1 
 
 
415 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 
411 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  36.49 
 
 
593 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  34.72 
 
 
407 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  37.1 
 
 
599 aa  169  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 
414 aa  169  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  30.75 
 
 
416 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 
411 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  33.58 
 
 
407 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 
411 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3330  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.46 
 
 
436 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 
422 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.31 
 
 
407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  34.38 
 
 
411 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 
411 aa  167  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  34.38 
 
 
411 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2168  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.63 
 
 
394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.440268  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  30.91 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  32.11 
 
 
431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  34.36 
 
 
589 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  32.84 
 
 
428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  34.1 
 
 
429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.25 
 
 
417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  36.88 
 
 
437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7813  allantoate amidohydrolase  32.47 
 
 
415 aa  162  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  34.01 
 
 
414 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  32.23 
 
 
420 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1867  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.44 
 
 
413 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.608993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  29.76 
 
 
425 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 
411 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 
411 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 
411 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 
411 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.16 
 
 
420 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.16 
 
 
420 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  35.79 
 
 
425 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.28 
 
 
415 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3270  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.11 
 
 
431 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3100  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.52 
 
 
518 aa  159  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  34.46 
 
 
421 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5235  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 
407 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.53 
 
 
418 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  34.08 
 
 
591 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1247  amidase  33.51 
 
 
408 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  34.72 
 
 
592 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  35.87 
 
 
417 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  31.9 
 
 
427 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  31.44 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  31.17 
 
 
415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  32.85 
 
 
419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  31.63 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.58 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.9 
 
 
416 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  34.07 
 
 
418 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.48 
 
 
426 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  31.31 
 
 
442 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  34.01 
 
 
408 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  32.89 
 
 
591 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.86 
 
 
407 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  32.49 
 
 
419 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.86 
 
 
427 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2575  allantoate amidohydrolase  34.62 
 
 
416 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124568  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  31.63 
 
 
427 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  34.02 
 
 
430 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4007  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 
430 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.74 
 
 
426 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  30.65 
 
 
415 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  33.09 
 
 
424 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  35.47 
 
 
592 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>