288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3711 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1574  allantoate amidohydrolase  82.46 
 
 		 400 aa  649    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.914199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2555  allantoate amidohydrolase  87.22 
 
 		 403 aa  698    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3711  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 400 aa  795    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7037  allantoate amidohydrolase  53.15 
 
 		 419 aa  401  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4610  allantoate amidohydrolase  48.74 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0920058  normal  0.113681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4127  allantoate amidohydrolase  47.49 
 
 		 413 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.638137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0554  allantoate amidohydrolase  46.23 
 
 		 413 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  36.57 
 
 		 412 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.3 
 
 		 415 aa  212  9e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34 
 
 		 413 aa  200  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  34.63 
 
 		 409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  37.96 
 
 		 417 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  34 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  33.58 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.85 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  34.3 
 
 		 423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.25 
 
 		 407 aa  182  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.58 
 
 		 447 aa  182  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  32.45 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  35.37 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  32.26 
 
 		 416 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  33.58 
 
 		 429 aa  176  5e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  34.22 
 
 		 430 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  33.51 
 
 		 416 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  34.13 
 
 		 407 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  34.13 
 
 		 407 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  35.73 
 
 		 421 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  33.89 
 
 		 407 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  35.68 
 
 		 437 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  33.17 
 
 		 414 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3330  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.28 
 
 		 436 aa  172  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  33.94 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.25 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.73 
 
 		 419 aa  170  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  34.62 
 
 		 422 aa  170  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  33.75 
 
 		 407 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  34.46 
 
 		 411 aa  169  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  35.38 
 
 		 414 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  33.07 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1507  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.84 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0692764 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  35.64 
 
 		 422 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  33.07 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  34.07 
 
 		 442 aa  167  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  33.17 
 
 		 415 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  33.6 
 
 		 589 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  32.58 
 
 		 411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  32.58 
 
 		 411 aa  166  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4007  allantoate amidohydrolase  35.34 
 
 		 430 aa  166  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  32.58 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  32.58 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  34.02 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  30.17 
 
 		 425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2168  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.4 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.440268  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  34.01 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  35.37 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  35.37 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  31.27 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  32.84 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  31.89 
 
 		 427 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  34.01 
 
 		 411 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  34.01 
 
 		 411 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.75 
 
 		 421 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  34.01 
 
 		 411 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  31.99 
 
 		 422 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  29.03 
 
 		 411 aa  162  7e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  33.57 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  31.91 
 
 		 427 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  33.58 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  32.21 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  36.15 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.76 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  32.16 
 
 		 427 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1867  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.84 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.608993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  32.17 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  31.76 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  34.36 
 
 		 426 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7813  allantoate amidohydrolase  31.94 
 
 		 415 aa  159  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.17 
 
 		 427 aa  159  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  32.16 
 
 		 421 aa  159  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.16 
 
 		 420 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.16 
 
 		 420 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3752  allantoate amidohydrolase  34.99 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  37.43 
 
 		 599 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5235  allantoate amidohydrolase  32.85 
 
 		 407 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  33.51 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.11 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  34.71 
 
 		 591 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  34.1 
 
 		 416 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  33.88 
 
 		 589 aa  158  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  32.27 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1015  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.41 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  32.2 
 
 		 415 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  31.77 
 
 		 419 aa  156  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3270  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.73 
 
 		 431 aa  155  8e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  30.13 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.09 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4047  allantoate amidohydrolase  34.99 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.439433 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  33.01 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  34.81 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>