273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4610 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4610  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 414 aa  828    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0920058  normal  0.113681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4127  allantoate amidohydrolase  73.6 
 
 		 413 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.638137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0554  allantoate amidohydrolase  73.86 
 
 		 413 aa  579  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3711  allantoate amidohydrolase  48.77 
 
 		 400 aa  341  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7037  allantoate amidohydrolase  47.69 
 
 		 419 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2555  allantoate amidohydrolase  47.89 
 
 		 403 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1574  allantoate amidohydrolase  48.14 
 
 		 400 aa  325  6e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.914199 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  35.51 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.06 
 
 		 413 aa  206  8e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  33.75 
 
 		 429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  37.47 
 
 		 421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5235  allantoate amidohydrolase  36.36 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.85 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.85 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.93 
 
 		 447 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  36.65 
 
 		 407 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  36.65 
 
 		 407 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  35.61 
 
 		 429 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3330  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.98 
 
 		 436 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  35.51 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.67 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  35.66 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  36.36 
 
 		 427 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  36.41 
 
 		 407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  35.12 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  34.14 
 
 		 415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.14 
 
 		 418 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  35.39 
 
 		 427 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  35.12 
 
 		 425 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.67 
 
 		 426 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  33.74 
 
 		 420 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  35.11 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  36.11 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  35.27 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.45 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  35.22 
 
 		 429 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  35.15 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.05 
 
 		 415 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.22 
 
 		 523 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 416 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  33.17 
 
 		 416 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  34.94 
 
 		 421 aa  186  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  35.27 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  36.5 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  33.82 
 
 		 415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  34.28 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  34.84 
 
 		 418 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  37.32 
 
 		 414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  32.69 
 
 		 431 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  35.48 
 
 		 408 aa  182  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  35.78 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3291  allantoate amidohydrolase  33.17 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17984  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  36.03 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  36.25 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  36.36 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.29 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  36.17 
 
 		 418 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  33.58 
 
 		 424 aa  180  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  36.43 
 
 		 426 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  36.14 
 
 		 426 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  33.33 
 
 		 411 aa  179  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.33 
 
 		 430 aa  179  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  35.93 
 
 		 418 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  34.98 
 
 		 418 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  36.19 
 
 		 426 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  34.75 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  36.14 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  36.19 
 
 		 426 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  32.51 
 
 		 411 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  34.24 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1461  allantoate amidohydrolase  33.1 
 
 		 419 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.39 
 
 		 415 aa  176  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  32.6 
 
 		 411 aa  176  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  32.84 
 
 		 411 aa  176  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  32.84 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.92 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  32.84 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  34.2 
 
 		 431 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  34.04 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3036  allantoate amidohydrolase  32.7 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.376517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  34.83 
 
 		 419 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  32.43 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  32.43 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  34.47 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3455  allantoate amidohydrolase  31.58 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423786  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  31.3 
 
 		 411 aa  174  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  34.28 
 
 		 421 aa  174  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  35.75 
 
 		 418 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  34.49 
 
 		 415 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  35.75 
 
 		 418 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  35.75 
 
 		 418 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  31.39 
 
 		 425 aa  172  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1817  allantoate amidohydrolase  32.86 
 
 		 419 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.545008  normal  0.138716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0184  allantoate amidohydrolase  32.86 
 
 		 419 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  32.27 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  36.21 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  34.87 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2575  allantoate amidohydrolase  35.75 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124568  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  32.78 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>