117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2121 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  350  5.9999999999999994e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  81.98 
 
 		 174 aa  291  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  83.14 
 
 		 174 aa  279  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  73.26 
 
 		 173 aa  256  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  71.1 
 
 		 172 aa  247  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  69.51 
 
 		 173 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  69.51 
 
 		 173 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  69.51 
 
 		 173 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  69.51 
 
 		 170 aa  223  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  68.29 
 
 		 173 aa  222  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1950  hypothetical protein  68.29 
 
 		 173 aa  222  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  66.08 
 
 		 173 aa  222  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  67.68 
 
 		 173 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  66.46 
 
 		 173 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  66.67 
 
 		 174 aa  217  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  65.5 
 
 		 173 aa  217  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  65.5 
 
 		 174 aa  208  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  65.5 
 
 		 173 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  65.5 
 
 		 174 aa  208  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  65.5 
 
 		 174 aa  208  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  65.5 
 
 		 174 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  65.5 
 
 		 174 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  56.89 
 
 		 592 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  55.42 
 
 		 592 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  55.88 
 
 		 589 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  55.88 
 
 		 589 aa  171  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  56.29 
 
 		 593 aa  170  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  55.09 
 
 		 592 aa  164  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  51.18 
 
 		 591 aa  161  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  54.86 
 
 		 599 aa  159  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  52.35 
 
 		 591 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2708  hypothetical protein  47.65 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  53.8 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  47.4 
 
 		 173 aa  154  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4287  hypothetical protein  48.43 
 
 		 171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1581  hypothetical protein  48.43 
 
 		 171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.288278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0067  hypothetical protein  50.96 
 
 		 174 aa  151  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3613  hypothetical protein  46.71 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00378889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  47.27 
 
 		 167 aa  151  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3851  hypothetical protein  49.68 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750718  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  46.78 
 
 		 176 aa  148  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1808  hypothetical protein  49.68 
 
 		 171 aa  147  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1705  hypothetical protein  50 
 
 		 171 aa  147  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2600  hypothetical protein  46.67 
 
 		 179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3667  hypothetical protein  49.03 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  45.73 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  50.59 
 
 		 599 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  50 
 
 		 171 aa  144  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  45.68 
 
 		 178 aa  144  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3819  hypothetical protein  49.03 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0873335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44840  hypothetical protein  48.39 
 
 		 171 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.68 
 
 		 594 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  47.5 
 
 		 475 aa  135  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  47.5 
 
 		 475 aa  135  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  52.12 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  46.51 
 
 		 470 aa  134  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4490  hypothetical protein  47.47 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.910632  normal  0.397544 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  46.3 
 
 		 470 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  48.8 
 
 		 294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  44.71 
 
 		 292 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  46.58 
 
 		 471 aa  132  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  47.44 
 
 		 475 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  46.91 
 
 		 471 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2831  polysaccharide deacetylase  43.79 
 
 		 478 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.729324  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5459  OHCU decarboxylase  43.93 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  46.06 
 
 		 471 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  43.45 
 
 		 470 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  45.45 
 
 		 471 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3347  hypothetical protein  42.42 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.943196  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  46.34 
 
 		 170 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  44.72 
 
 		 482 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  40.74 
 
 		 166 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2887  OHCU decarboxylase  42.04 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  44.72 
 
 		 470 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  44.72 
 
 		 470 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  43.59 
 
 		 471 aa  114  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49522  predicted protein  39.1 
 
 		 299 aa  112  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.219975  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0035  putative uricase  40.48 
 
 		 175 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7199  hypothetical protein  43.04 
 
 		 475 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  44.1 
 
 		 470 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1150  hypothetical protein  50.6 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.738978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  43.4 
 
 		 478 aa  97.8  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  29.82 
 
 		 166 aa  94  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  42.77 
 
 		 478 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03789  chitooligosaccharide deacetylase  40 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  32.16 
 
 		 665 aa  84.7  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  31.33 
 
 		 825 aa  84.7  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5250  OHCU decarboxylase  41.57 
 
 		 289 aa  80.9  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00421596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  29.76 
 
 		 640 aa  78.2  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  31.93 
 
 		 647 aa  75.5  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  33.93 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5814  hydroxyisourate hydrolase  34.94 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  31.36 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  30.72 
 
 		 633 aa  62  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  30.12 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  30.12 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  26.32 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  29.34 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  31.33 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  28.22 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>