122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0837 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  100 
 
 
166 aa  338  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  38.89 
 
 
163 aa  118  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  36.81 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  36.09 
 
 
173 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  34.91 
 
 
170 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  103  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  34.13 
 
 
172 aa  101  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  34.73 
 
 
171 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  32.14 
 
 
173 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1950  hypothetical protein  32.14 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  32.14 
 
 
173 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  32.74 
 
 
174 aa  99  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  37.89 
 
 
176 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  31.55 
 
 
173 aa  98.2  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  31.55 
 
 
173 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  31.55 
 
 
173 aa  98.2  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  34.18 
 
 
190 aa  97.4  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  39.24 
 
 
471 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  30.54 
 
 
174 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  30.95 
 
 
173 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 
470 aa  95.9  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3819  hypothetical protein  37.27 
 
 
171 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0873335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3851  hypothetical protein  33.14 
 
 
171 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750718  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3667  hypothetical protein  32.32 
 
 
176 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  31.74 
 
 
173 aa  94.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1705  hypothetical protein  32.54 
 
 
171 aa  94  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589299  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  38.61 
 
 
471 aa  94  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  32.14 
 
 
173 aa  93.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44840  hypothetical protein  36.65 
 
 
171 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.165597 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  32.14 
 
 
174 aa  93.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  32.14 
 
 
174 aa  93.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4287  hypothetical protein  32.54 
 
 
171 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  34.38 
 
 
475 aa  92.8  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2600  hypothetical protein  34.73 
 
 
179 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562153  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  34.38 
 
 
475 aa  92.8  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1581  hypothetical protein  32.54 
 
 
171 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.288278  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  33.73 
 
 
592 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  32.14 
 
 
174 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  32.14 
 
 
174 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  32.14 
 
 
174 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  36.02 
 
 
471 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  30.54 
 
 
174 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  35.37 
 
 
471 aa  91.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  29.59 
 
 
599 aa  91.3  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3613  hypothetical protein  31.98 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00378889  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  34.36 
 
 
475 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  32.74 
 
 
169 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0067  hypothetical protein  35.03 
 
 
174 aa  89  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2831  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 
478 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.729324  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  34.88 
 
 
593 aa  88.6  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  29.82 
 
 
173 aa  87.8  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  35.22 
 
 
471 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  31.95 
 
 
589 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  33.54 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  34.15 
 
 
165 aa  85.1  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  31.95 
 
 
589 aa  85.1  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2708  hypothetical protein  33.53 
 
 
173 aa  84.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  32.34 
 
 
592 aa  84  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  31.36 
 
 
592 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  34.52 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1150  hypothetical protein  37.89 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.738978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1808  hypothetical protein  30.25 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  33.95 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  33.12 
 
 
470 aa  82  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5459  OHCU decarboxylase  30.72 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  30.61 
 
 
599 aa  80.1  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2887  OHCU decarboxylase  34.76 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  31.29 
 
 
825 aa  79.7  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  28.99 
 
 
591 aa  79  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  34.34 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  31.75 
 
 
470 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  30 
 
 
591 aa  78.6  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  31.75 
 
 
470 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  27.78 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3347  hypothetical protein  34.16 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.943196  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  31.17 
 
 
470 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4490  hypothetical protein  32.52 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.910632  normal  0.397544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  35.07 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  36.94 
 
 
470 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  28.92 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  33.96 
 
 
478 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  30.06 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  34.38 
 
 
478 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  29.34 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0035  putative uricase  30.12 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  28.14 
 
 
594 aa  67.8  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  26.79 
 
 
516 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  30.15 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49522  predicted protein  30.14 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.219975  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  31.45 
 
 
482 aa  65.5  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  28.65 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  31.09 
 
 
198 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  26.88 
 
 
177 aa  61.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  27.06 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  26.22 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  29.5 
 
 
197 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5250  OHCU decarboxylase  31.71 
 
 
289 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00421596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  27.52 
 
 
520 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  25.95 
 
 
640 aa  58.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>