77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3454 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  100 
 
 
165 aa  330  7.000000000000001e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  73.33 
 
 
165 aa  241  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  53.66 
 
 
165 aa  176  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  53.05 
 
 
163 aa  166  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  51.22 
 
 
196 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  49.37 
 
 
825 aa  145  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  44.24 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  46.67 
 
 
166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  43.83 
 
 
193 aa  121  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  40.12 
 
 
182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  41.82 
 
 
169 aa  107  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  38.12 
 
 
231 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  39.13 
 
 
164 aa  101  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  38.61 
 
 
177 aa  99.8  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  41.38 
 
 
197 aa  99  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  38.51 
 
 
520 aa  97.1  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  37.93 
 
 
516 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  31.74 
 
 
168 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  37.8 
 
 
166 aa  94.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  32.35 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  36.97 
 
 
165 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  44.76 
 
 
179 aa  84.3  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  39.53 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  30.95 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  28.92 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  33.96 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  34.81 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  25.15 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  26.09 
 
 
172 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  24.54 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  24.54 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  31.1 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  29.27 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  29.09 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1950  hypothetical protein  30.49 
 
 
173 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  29.88 
 
 
173 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  29.27 
 
 
173 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  29.88 
 
 
173 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  33.65 
 
 
478 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  29.88 
 
 
173 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  29.27 
 
 
173 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  29.77 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  29.27 
 
 
174 aa  52  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  29.32 
 
 
190 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  29.48 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3347  hypothetical protein  32.43 
 
 
169 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.943196  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  29.27 
 
 
174 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  29.27 
 
 
174 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  29.27 
 
 
173 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  29.27 
 
 
174 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  29.27 
 
 
174 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  29.27 
 
 
174 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  30.97 
 
 
166 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  30.36 
 
 
475 aa  47.4  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  30.36 
 
 
475 aa  47.4  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  27.06 
 
 
591 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1150  hypothetical protein  34.13 
 
 
180 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.738978  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  33.33 
 
 
471 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  29.91 
 
 
475 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1407  putative OHCU decarboxylase  24.84 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  28.14 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  26.19 
 
 
172 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2887  OHCU decarboxylase  31.37 
 
 
166 aa  44.7  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  30.36 
 
 
170 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  34.31 
 
 
169 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  29.29 
 
 
171 aa  44.3  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  30.97 
 
 
482 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  29.09 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  27.88 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2600  hypothetical protein  24.4 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562153  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  29.17 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  31.73 
 
 
478 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2831  polysaccharide deacetylase  35.59 
 
 
478 aa  41.6  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.729324  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29775  predicted protein  30.49 
 
 
194 aa  41.2  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0067  hypothetical protein  31.4 
 
 
174 aa  40.4  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5459  OHCU decarboxylase  25.3 
 
 
175 aa  40.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00070  conserved hypothetical protein  30.47 
 
 
183 aa  40.4  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.531908  normal  0.657367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>