77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5382 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  100 
 
 
172 aa  359  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1407  putative OHCU decarboxylase  85.47 
 
 
173 aa  290  8e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  75.58 
 
 
173 aa  280  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  75.58 
 
 
173 aa  280  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  75 
 
 
173 aa  280  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  41.1 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  39.38 
 
 
165 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  38.61 
 
 
179 aa  90.9  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  32.39 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  30.67 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  30 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  29.82 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  33.82 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  27.92 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  29.45 
 
 
825 aa  64.3  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  29.52 
 
 
182 aa  62  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  25 
 
 
166 aa  61.2  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  23.78 
 
 
168 aa  61.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  31.21 
 
 
164 aa  61.2  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  26.29 
 
 
520 aa  60.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  28.48 
 
 
163 aa  59.7  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3347  hypothetical protein  32.41 
 
 
169 aa  58.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.943196  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  24.57 
 
 
516 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  27.78 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  24.22 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  33.59 
 
 
640 aa  55.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  22.42 
 
 
169 aa  55.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  26.88 
 
 
196 aa  54.7  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  34.15 
 
 
198 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  26.51 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  27.59 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  30.28 
 
 
478 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  31.62 
 
 
471 aa  52  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  32.38 
 
 
478 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4490  hypothetical protein  32.69 
 
 
167 aa  50.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.910632  normal  0.397544 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  25.3 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  26.38 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  30.84 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  25 
 
 
173 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 
470 aa  48.5  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  31.48 
 
 
482 aa  48.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  28.04 
 
 
169 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  25.15 
 
 
173 aa  48.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  23.46 
 
 
592 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2887  OHCU decarboxylase  28.04 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2708  hypothetical protein  26.11 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  25.58 
 
 
173 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1808  hypothetical protein  24.09 
 
 
171 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  30.39 
 
 
171 aa  45.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  28.33 
 
 
176 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  21.71 
 
 
173 aa  44.7  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  29.82 
 
 
475 aa  44.7  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  27.45 
 
 
167 aa  44.7  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1950  hypothetical protein  22.56 
 
 
173 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  22.7 
 
 
174 aa  44.3  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  22.88 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5814  hydroxyisourate hydrolase  32.58 
 
 
279 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  31.58 
 
 
475 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0067  hypothetical protein  26.47 
 
 
174 aa  43.5  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  23.78 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  31.58 
 
 
475 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  22.56 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  26.12 
 
 
166 aa  42.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  22.22 
 
 
173 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  21.95 
 
 
173 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  22.22 
 
 
173 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  28.97 
 
 
471 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1581  hypothetical protein  28.93 
 
 
171 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.288278  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  22.22 
 
 
173 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 
470 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4287  hypothetical protein  28.93 
 
 
171 aa  42  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3613  hypothetical protein  28.93 
 
 
171 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00378889  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  22.94 
 
 
172 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1705  hypothetical protein  26.81 
 
 
171 aa  41.6  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589299  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3819  hypothetical protein  25.83 
 
 
171 aa  41.2  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0873335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3851  hypothetical protein  28.1 
 
 
171 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750718  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  28.21 
 
 
174 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>