102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5938 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  100 
 
 		 164 aa  323  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  45.16 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  43.11 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  43.59 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  41.45 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  38.18 
 
 		 825 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  38.51 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  41.06 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  42.95 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  43.66 
 
 		 231 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  35.59 
 
 		 516 aa  94.4  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  37.29 
 
 		 520 aa  94  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  40.97 
 
 		 177 aa  93.2  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  46.15 
 
 		 193 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  39.74 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  40.25 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  37.27 
 
 		 165 aa  87  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  37.41 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  38.12 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  38.41 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  29.81 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  38.58 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  35.07 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  27.89 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  32.89 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  31.34 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2600  hypothetical protein  30.56 
 
 		 179 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562153  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  31.21 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  28.46 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  34.62 
 
 		 478 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  31.45 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  32.14 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  30.65 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  30.65 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  32.43 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  30.99 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  32.54 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  40 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  33.33 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  27.21 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  36.36 
 
 		 294 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  35.64 
 
 		 470 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  27.66 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 592 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  32.82 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  32.82 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  32.82 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  35.64 
 
 		 470 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  28.83 
 
 		 471 aa  52  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  30 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2887  OHCU decarboxylase  30.63 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  27.93 
 
 		 475 aa  51.6  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  32.86 
 
 		 173 aa  51.2  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  32.06 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  32.06 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  32.06 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1950  hypothetical protein  32.14 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  29.29 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2831  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 		 478 aa  48.5  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.729324  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1150  hypothetical protein  33.59 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.738978  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  30 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  26.61 
 
 		 475 aa  48.1  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  26.61 
 
 		 475 aa  48.1  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  29.08 
 
 		 591 aa  48.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3819  hypothetical protein  31.62 
 
 		 171 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0873335  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  33.96 
 
 		 478 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  32.58 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  34 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44840  hypothetical protein  31.62 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  27.52 
 
 		 482 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  30 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  30 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  31.43 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  30.71 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  30.71 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  28.37 
 
 		 589 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  30.71 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 		 471 aa  45.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  32.33 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  32.67 
 
 		 470 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  27.78 
 
 		 471 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3667  hypothetical protein  29.06 
 
 		 176 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  29.77 
 
 		 174 aa  44.3  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3347  hypothetical protein  27.78 
 
 		 169 aa  43.9  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.943196  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 471 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0067  hypothetical protein  28.46 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 471 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  27.66 
 
 		 591 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  27.66 
 
 		 589 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  31 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1808  hypothetical protein  28 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  27.66 
 
 		 173 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 		 470 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  29.1 
 
 		 592 aa  42.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4490  hypothetical protein  36.92 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.910632  normal  0.397544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3851  hypothetical protein  28.21 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750718  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3613  hypothetical protein  28.21 
 
 		 171 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00378889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4287  hypothetical protein  28.21 
 
 		 171 aa  42  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1581  hypothetical protein  28.21 
 
 		 171 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.288278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  25.93 
 
 		 594 aa  41.6  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>