95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2536 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  100 
 
 
166 aa  322  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  48.1 
 
 
231 aa  124  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  46.98 
 
 
197 aa  121  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  40.85 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  44.72 
 
 
825 aa  114  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  45.45 
 
 
193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  39.63 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  40.24 
 
 
166 aa  107  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  42.33 
 
 
182 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  40.25 
 
 
164 aa  99  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  37.8 
 
 
165 aa  97.1  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  41.46 
 
 
196 aa  96.7  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  46.54 
 
 
179 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  39.63 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  31.74 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  42.68 
 
 
169 aa  95.1  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  37.04 
 
 
177 aa  93.2  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  31.52 
 
 
169 aa  92  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  33.33 
 
 
188 aa  90.9  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  36.2 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  37.36 
 
 
516 aa  89  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  35.37 
 
 
166 aa  85.9  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  36.21 
 
 
520 aa  84.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  37.59 
 
 
139 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  38.67 
 
 
198 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  35 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  29.94 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  32.16 
 
 
169 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  28.4 
 
 
592 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  28.74 
 
 
593 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  35.25 
 
 
478 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  28.74 
 
 
589 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  26.22 
 
 
166 aa  54.7  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  28.74 
 
 
173 aa  54.3  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  26.38 
 
 
172 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2600  hypothetical protein  30.36 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562153  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  26.38 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  26.38 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  26.38 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  28.74 
 
 
589 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  28.75 
 
 
470 aa  51.6  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1407  putative OHCU decarboxylase  28.22 
 
 
173 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  26.95 
 
 
163 aa  51.6  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  34.95 
 
 
171 aa  50.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  34.59 
 
 
173 aa  50.8  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  35.92 
 
 
470 aa  50.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  32.73 
 
 
475 aa  50.8  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  32.73 
 
 
475 aa  50.8  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  25.15 
 
 
591 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  33.33 
 
 
478 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  26.79 
 
 
592 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  32.04 
 
 
475 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  29.52 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  34.68 
 
 
470 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  30.36 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  34.68 
 
 
470 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  32.14 
 
 
482 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  26.19 
 
 
173 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  32.69 
 
 
167 aa  48.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  24.7 
 
 
173 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  27.54 
 
 
599 aa  48.1  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  34.68 
 
 
470 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3347  hypothetical protein  32.69 
 
 
169 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.943196  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  28.98 
 
 
592 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  25.15 
 
 
173 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0035  putative uricase  30.2 
 
 
175 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  30.16 
 
 
471 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  24.24 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  31.07 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  24.85 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  25 
 
 
591 aa  45.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3667  hypothetical protein  30.77 
 
 
176 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  29.17 
 
 
166 aa  44.7  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  25.3 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  25.3 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  25.3 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  31.75 
 
 
471 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  25.15 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  28.82 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  25.15 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  26.52 
 
 
190 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  25.15 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  23.64 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 
471 aa  43.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  24.7 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  24.7 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  24.7 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  28.05 
 
 
292 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1808  hypothetical protein  30.36 
 
 
171 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  29.55 
 
 
294 aa  42  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  30.12 
 
 
173 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  30.77 
 
 
599 aa  41.2  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  25.71 
 
 
594 aa  40.8  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  30.53 
 
 
633 aa  40.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>