240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0215 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  100 
 
 		 292 aa  585  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  45.42 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49522  predicted protein  38.97 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.219975  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5250  OHCU decarboxylase  42.86 
 
 		 289 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00421596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5814  hydroxyisourate hydrolase  38.93 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2600  hypothetical protein  50.62 
 
 		 179 aa  153  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562153  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  47.2 
 
 		 173 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  43.03 
 
 		 174 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  47.83 
 
 		 178 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  42.51 
 
 		 173 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  41.98 
 
 		 173 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  48.41 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  43.83 
 
 		 174 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3667  hypothetical protein  46.05 
 
 		 176 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0067  hypothetical protein  49.07 
 
 		 174 aa  136  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  42.94 
 
 		 174 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  43.12 
 
 		 172 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  43.21 
 
 		 173 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  43.21 
 
 		 174 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  43.21 
 
 		 174 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  43.21 
 
 		 174 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1950  hypothetical protein  41.36 
 
 		 173 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  43.21 
 
 		 174 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  43.21 
 
 		 174 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  44.71 
 
 		 173 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  41.98 
 
 		 173 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  40.74 
 
 		 173 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  40.74 
 
 		 173 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3819  hypothetical protein  44.05 
 
 		 171 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0873335  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  40.74 
 
 		 173 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  40.74 
 
 		 173 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.18 
 
 		 592 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  42.86 
 
 		 176 aa  132  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2708  hypothetical protein  42.42 
 
 		 173 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  40.12 
 
 		 173 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1808  hypothetical protein  44.74 
 
 		 171 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44840  hypothetical protein  42.86 
 
 		 171 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3613  hypothetical protein  40.76 
 
 		 171 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00378889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2831  polysaccharide deacetylase  42.42 
 
 		 478 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.729324  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  43.29 
 
 		 163 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3851  hypothetical protein  40.48 
 
 		 171 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750718  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  60.55 
 
 		 230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4287  hypothetical protein  41.4 
 
 		 171 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1581  hypothetical protein  41.4 
 
 		 171 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.288278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  44.03 
 
 		 171 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  42.17 
 
 		 471 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  42.07 
 
 		 167 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  40.12 
 
 		 170 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  42.94 
 
 		 475 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  42.94 
 
 		 475 aa  123  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.67 
 
 		 589 aa  122  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  45.96 
 
 		 471 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3347  hypothetical protein  43.14 
 
 		 169 aa  122  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.943196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1705  hypothetical protein  42.11 
 
 		 171 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 		 471 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  39.51 
 
 		 173 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  42.95 
 
 		 475 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  41.61 
 
 		 166 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  41.42 
 
 		 591 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.07 
 
 		 589 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.08 
 
 		 592 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  46.67 
 
 		 599 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  40.96 
 
 		 470 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  42.24 
 
 		 471 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0779  putative purine catabolism-related protein  57.14 
 
 		 117 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5459  OHCU decarboxylase  42.86 
 
 		 175 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2887  OHCU decarboxylase  41.21 
 
 		 166 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1390  hydroxyisourate hydrolase  56.67 
 
 		 118 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177512  normal  0.143867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2832  transthyretin  52.76 
 
 		 121 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  43.64 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  43.64 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  46.15 
 
 		 482 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  36.47 
 
 		 591 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4490  hypothetical protein  45.51 
 
 		 167 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.910632  normal  0.397544 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.62 
 
 		 593 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  38.79 
 
 		 470 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  37.13 
 
 		 592 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  36.84 
 
 		 594 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  46.34 
 
 		 478 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  45.96 
 
 		 478 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.52 
 
 		 599 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  41.88 
 
 		 170 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  43.03 
 
 		 470 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3721  hydroxyisourate hydrolase  49.57 
 
 		 115 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  36.53 
 
 		 470 aa  105  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  35.54 
 
 		 825 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03789  chitooligosaccharide deacetylase  48.65 
 
 		 186 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0035  putative uricase  40 
 
 		 175 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 471 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2434  transthyretin  51.26 
 
 		 117 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1102  hydroxyisourate hydrolase  53.33 
 
 		 118 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0885  transthyretin  51.26 
 
 		 117 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0621325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  44.59 
 
 		 169 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1745  hydroxyisourate hydrolase  52.1 
 
 		 131 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2116  putative transthyretin-like protein precursor  49.58 
 
 		 117 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.851558 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2072  transthyretin family protein  51.26 
 
 		 194 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835202  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3291  hydroxyisourate hydrolase  50 
 
 		 117 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.379415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1555  transthyretin-like protein  52.94 
 
 		 117 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552439  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3340  hydroxyisourate hydrolase  50.83 
 
 		 118 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2256  hydroxyisourate hydrolase  48.74 
 
 		 117 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.894815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>