97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03789 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03789  chitooligosaccharide deacetylase  100 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  51.41 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3667  hypothetical protein  42.21 
 
 		 176 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2600  hypothetical protein  44.83 
 
 		 179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562153  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  45.03 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1808  hypothetical protein  39.61 
 
 		 171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  42.57 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  48.65 
 
 		 292 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  41.38 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  44.14 
 
 		 163 aa  107  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3819  hypothetical protein  40.4 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0873335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  40.69 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44840  hypothetical protein  43.05 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3347  hypothetical protein  39.61 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.943196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  39.31 
 
 		 173 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  38.62 
 
 		 173 aa  104  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  40.69 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  38.41 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  38.96 
 
 		 475 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  38.96 
 
 		 475 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  38.62 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1950  hypothetical protein  38.62 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  38.62 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  38.62 
 
 		 173 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  40 
 
 		 174 aa  101  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  41.22 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  41.22 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  39.31 
 
 		 173 aa  101  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  41.22 
 
 		 173 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4490  hypothetical protein  43.05 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.910632  normal  0.397544 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  41.22 
 
 		 174 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  41.22 
 
 		 174 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  41.22 
 
 		 174 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  37.93 
 
 		 173 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3613  hypothetical protein  37.16 
 
 		 171 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00378889  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  40 
 
 		 173 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  41.77 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0067  hypothetical protein  43.14 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  37.84 
 
 		 174 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1705  hypothetical protein  36.42 
 
 		 171 aa  99  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  37.66 
 
 		 471 aa  98.6  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3851  hypothetical protein  36.36 
 
 		 171 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750718  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  40.4 
 
 		 171 aa  97.8  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  37.01 
 
 		 475 aa  97.4  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  37.16 
 
 		 174 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  38.41 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4287  hypothetical protein  36.49 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1581  hypothetical protein  36.49 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.288278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  39.1 
 
 		 471 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 471 aa  95.9  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2831  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 478 aa  96.3  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.729324  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  41.61 
 
 		 478 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  35.95 
 
 		 471 aa  95.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  41.38 
 
 		 170 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2887  OHCU decarboxylase  38.96 
 
 		 166 aa  94.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.54 
 
 		 599 aa  94.4  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 		 471 aa  93.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  40.13 
 
 		 482 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2708  hypothetical protein  33.76 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  40.83 
 
 		 478 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.82 
 
 		 593 aa  92  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5459  OHCU decarboxylase  39.58 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7199  hypothetical protein  36 
 
 		 475 aa  92  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  42.76 
 
 		 294 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  36.73 
 
 		 592 aa  90.5  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  38.73 
 
 		 167 aa  90.9  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  33.74 
 
 		 470 aa  89.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  34.16 
 
 		 591 aa  89  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  37.41 
 
 		 592 aa  88.2  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  37.67 
 
 		 592 aa  88.2  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  35.37 
 
 		 594 aa  85.5  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  40.41 
 
 		 169 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  38.16 
 
 		 470 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  36.18 
 
 		 470 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  36.18 
 
 		 470 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  36.42 
 
 		 470 aa  83.2  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  44.66 
 
 		 589 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5250  OHCU decarboxylase  43.36 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00421596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  36.49 
 
 		 470 aa  81.6  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  37.41 
 
 		 591 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.69 
 
 		 589 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5814  hydroxyisourate hydrolase  37.06 
 
 		 279 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  36.73 
 
 		 599 aa  76.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0035  putative uricase  34.01 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49522  predicted protein  28.77 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.219975  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1150  hypothetical protein  40.98 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.738978  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  29.14 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  29.61 
 
 		 825 aa  58.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  26.54 
 
 		 665 aa  51.2  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  26.85 
 
 		 640 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  29.03 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  29.03 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  28.35 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  32.76 
 
 		 138 aa  42.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  28.95 
 
 		 139 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  28.23 
 
 		 173 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  25.71 
 
 		 633 aa  41.6  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>