113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4490 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4490  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  335  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.910632  normal  0.397544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  68.1 
 
 		 166 aa  227  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3347  hypothetical protein  66.46 
 
 		 169 aa  220  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.943196  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2887  OHCU decarboxylase  68.1 
 
 		 166 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  63.58 
 
 		 471 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  59.64 
 
 		 475 aa  185  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  60 
 
 		 475 aa  184  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  60 
 
 		 475 aa  184  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2831  polysaccharide deacetylase  58.02 
 
 		 478 aa  182  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.729324  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  56.79 
 
 		 471 aa  176  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  57.14 
 
 		 471 aa  175  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  59.75 
 
 		 470 aa  173  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  57.14 
 
 		 470 aa  168  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  54.04 
 
 		 471 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  54.04 
 
 		 471 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  51.88 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3819  hypothetical protein  52.5 
 
 		 171 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0873335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44840  hypothetical protein  51.88 
 
 		 171 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3667  hypothetical protein  51.25 
 
 		 176 aa  157  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  52.15 
 
 		 482 aa  157  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4287  hypothetical protein  50.62 
 
 		 171 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1581  hypothetical protein  50.62 
 
 		 171 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.288278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1705  hypothetical protein  49.38 
 
 		 171 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3613  hypothetical protein  50 
 
 		 171 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00378889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1808  hypothetical protein  50.62 
 
 		 171 aa  154  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  52.12 
 
 		 470 aa  154  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  49.38 
 
 		 171 aa  153  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3851  hypothetical protein  50.62 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750718  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0067  hypothetical protein  51.55 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  48.75 
 
 		 178 aa  144  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  51.52 
 
 		 470 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  51.52 
 
 		 470 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  46.88 
 
 		 190 aa  141  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2708  hypothetical protein  47.44 
 
 		 173 aa  140  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  45.34 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  47.13 
 
 		 173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  46.79 
 
 		 173 aa  138  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  45.62 
 
 		 173 aa  137  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2600  hypothetical protein  46.58 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562153  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  45.81 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  45.81 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  47.47 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  50.91 
 
 		 470 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  45.81 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  43.4 
 
 		 174 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  45.62 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  45.62 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  44.38 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  45.62 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  45.62 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  45.62 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  45.62 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  43.04 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1950  hypothetical protein  45.16 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  45.16 
 
 		 173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  44.52 
 
 		 173 aa  131  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  45 
 
 		 174 aa  131  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.24 
 
 		 592 aa  130  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  44.87 
 
 		 173 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  43.95 
 
 		 173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  43.4 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  45.62 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  49.04 
 
 		 478 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  47.5 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  48.43 
 
 		 478 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.62 
 
 		 592 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.68 
 
 		 592 aa  117  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5459  OHCU decarboxylase  41.36 
 
 		 175 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.67 
 
 		 599 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  42.38 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  46.05 
 
 		 292 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.87 
 
 		 593 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40 
 
 		 589 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7199  hypothetical protein  39.87 
 
 		 475 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.35 
 
 		 589 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  40.67 
 
 		 591 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0035  putative uricase  38.71 
 
 		 175 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  37.33 
 
 		 591 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  45.62 
 
 		 294 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49522  predicted protein  38.85 
 
 		 299 aa  105  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.219975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  37.34 
 
 		 594 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.12 
 
 		 599 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03789  chitooligosaccharide deacetylase  41.72 
 
 		 186 aa  90.1  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  33.95 
 
 		 825 aa  86.3  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  32.52 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5250  OHCU decarboxylase  43.15 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00421596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  34.34 
 
 		 665 aa  73.6  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1150  hypothetical protein  40.8 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.738978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5814  hydroxyisourate hydrolase  36.3 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  30.57 
 
 		 640 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  33.86 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  32.69 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  33.87 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  35.58 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  35.58 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  34.62 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  29.19 
 
 		 633 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  31.65 
 
 		 516 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  30.97 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  31.29 
 
 		 647 aa  49.7  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>