107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3667 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3667  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  360  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1808  hypothetical protein  84.21 
 
 		 171 aa  297  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1705  hypothetical protein  72.51 
 
 		 171 aa  258  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3819  hypothetical protein  70.18 
 
 		 171 aa  249  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0873335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  69.59 
 
 		 176 aa  248  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3851  hypothetical protein  69.01 
 
 		 171 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750718  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44840  hypothetical protein  68.42 
 
 		 171 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4287  hypothetical protein  68.42 
 
 		 171 aa  244  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1581  hypothetical protein  68.42 
 
 		 171 aa  244  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.288278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3613  hypothetical protein  67.25 
 
 		 171 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00378889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  64.33 
 
 		 171 aa  233  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0067  hypothetical protein  52.69 
 
 		 174 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  51.85 
 
 		 170 aa  168  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  53.09 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  52.47 
 
 		 173 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  52.47 
 
 		 174 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  52.47 
 
 		 174 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  51.23 
 
 		 173 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  52.47 
 
 		 174 aa  164  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  52.47 
 
 		 174 aa  164  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  52.47 
 
 		 174 aa  164  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1950  hypothetical protein  50.62 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  50.9 
 
 		 190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  49.38 
 
 		 173 aa  160  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  48.77 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  50.62 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  48.17 
 
 		 471 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2708  hypothetical protein  48.48 
 
 		 173 aa  158  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  48.47 
 
 		 475 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  50.32 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  47.2 
 
 		 475 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  47.2 
 
 		 475 aa  149  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  45.73 
 
 		 471 aa  148  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  51.22 
 
 		 169 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  45.68 
 
 		 166 aa  148  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  46.91 
 
 		 174 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  47.83 
 
 		 470 aa  147  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3347  hypothetical protein  49.38 
 
 		 169 aa  147  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.943196  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  46.91 
 
 		 470 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  46.91 
 
 		 470 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2831  polysaccharide deacetylase  43.29 
 
 		 478 aa  143  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.729324  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2887  OHCU decarboxylase  44.38 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4490  hypothetical protein  51.25 
 
 		 167 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.910632  normal  0.397544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  49.03 
 
 		 173 aa  141  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  46.79 
 
 		 172 aa  141  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  46.25 
 
 		 471 aa  141  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  44.72 
 
 		 470 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  45.57 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  46.2 
 
 		 173 aa  139  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  45 
 
 		 471 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  46.58 
 
 		 478 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  44.38 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  45 
 
 		 471 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  43.21 
 
 		 470 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  48.67 
 
 		 593 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  40.85 
 
 		 470 aa  128  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  46.36 
 
 		 599 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.42 
 
 		 592 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  43.9 
 
 		 482 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  42.86 
 
 		 478 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  39.77 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  46.05 
 
 		 292 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  46.67 
 
 		 589 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.59 
 
 		 592 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  46.67 
 
 		 589 aa  121  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  41.83 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2600  hypothetical protein  41.51 
 
 		 179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562153  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  44.97 
 
 		 592 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49522  predicted protein  42.07 
 
 		 299 aa  117  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.219975  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  43.33 
 
 		 591 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.99 
 
 		 594 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7199  hypothetical protein  35.8 
 
 		 475 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.37 
 
 		 591 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  40.12 
 
 		 170 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42 
 
 		 599 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5459  OHCU decarboxylase  34.57 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03789  chitooligosaccharide deacetylase  42.21 
 
 		 186 aa  97.4  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  38.27 
 
 		 294 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  32.32 
 
 		 166 aa  94.7  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  33.94 
 
 		 825 aa  90.5  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1150  hypothetical protein  39.38 
 
 		 180 aa  84.3  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.738978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0035  putative uricase  32.3 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  28.48 
 
 		 665 aa  73.2  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5250  OHCU decarboxylase  39.61 
 
 		 289 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00421596 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  24.24 
 
 		 647 aa  63.2  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  34.34 
 
 		 163 aa  62  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  25.75 
 
 		 640 aa  62  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5814  hydroxyisourate hydrolase  29.49 
 
 		 279 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  27.06 
 
 		 633 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  30.67 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  31.31 
 
 		 165 aa  52  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  30.61 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  30.61 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  26.98 
 
 		 173 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  26.98 
 
 		 173 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  29.06 
 
 		 164 aa  44.3  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>