234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5250 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5250  OHCU decarboxylase  100 
 
 		 289 aa  560  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00421596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5814  hydroxyisourate hydrolase  75.43 
 
 		 279 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  51.19 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  42.76 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49522  predicted protein  35 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.219975  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2600  hypothetical protein  48.8 
 
 		 179 aa  136  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562153  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  51.19 
 
 		 170 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  42.6 
 
 		 173 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  43.75 
 
 		 163 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3291  hydroxyisourate hydrolase  56.41 
 
 		 117 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.379415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  45.56 
 
 		 174 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  42.6 
 
 		 173 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1950  hypothetical protein  42.01 
 
 		 173 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1390  hydroxyisourate hydrolase  56.03 
 
 		 118 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177512  normal  0.143867 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  44.58 
 
 		 173 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  48.8 
 
 		 173 aa  122  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  40.83 
 
 		 173 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  40.83 
 
 		 173 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  40.83 
 
 		 173 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  40.83 
 
 		 173 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0695  hydroxyisourate hydrolase  52.14 
 
 		 118 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  40.83 
 
 		 173 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  43.71 
 
 		 172 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  40.83 
 
 		 170 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  40.83 
 
 		 173 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3036  transthyretin  51.72 
 
 		 117 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0508  hypothetical protein  50.43 
 
 		 118 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  44.05 
 
 		 173 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  44.05 
 
 		 174 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  44.05 
 
 		 174 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0511  hydroxyisourate hydrolase  50.43 
 
 		 118 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  43.95 
 
 		 190 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  43.45 
 
 		 174 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  43.45 
 
 		 174 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  43.45 
 
 		 174 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2434  transthyretin  47.41 
 
 		 117 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.02 
 
 		 592 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5459  OHCU decarboxylase  41.42 
 
 		 175 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2383  hydroxyisourate hydrolase  49.14 
 
 		 117 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.514314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2425  hydroxyisourate hydrolase  49.14 
 
 		 117 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1312  hydroxyisourate hydrolase  45.38 
 
 		 206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965379 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.02 
 
 		 593 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2527  putative purine catabolism-related protein  48.28 
 
 		 117 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0546176  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2064  hydroxyisourate hydrolase  47.69 
 
 		 130 aa  112  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.62 
 
 		 592 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2324  hydroxyisourate hydrolase  47.41 
 
 		 117 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.511264  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2072  transthyretin family protein  46.55 
 
 		 194 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835202  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1945  transthyretin  47.41 
 
 		 117 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1872  hydroxyisourate hydrolase  47.41 
 
 		 117 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  0.0980153 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6196  hydroxyisourate hydrolase  50.43 
 
 		 117 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1745  hydroxyisourate hydrolase  48.46 
 
 		 131 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1555  transthyretin-like protein  50 
 
 		 117 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552439  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5268  transthyretin  47.41 
 
 		 117 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  51.92 
 
 		 478 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0885  transthyretin  46.55 
 
 		 117 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0621325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  40 
 
 		 167 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6121  transthyretin  47.41 
 
 		 117 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1957  transthyretin  47.41 
 
 		 117 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1981  hydroxyisourate hydrolase  47.41 
 
 		 117 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  43.53 
 
 		 178 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2832  transthyretin  50 
 
 		 121 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0861  hydroxyisourate hydrolase  46.49 
 
 		 117 aa  109  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.386947  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2844  transthyretin  48.72 
 
 		 111 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1294  hydroxyisourate hydrolase  46.55 
 
 		 117 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3340  hydroxyisourate hydrolase  46.09 
 
 		 118 aa  109  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0779  putative purine catabolism-related protein  46.15 
 
 		 117 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2684  putative transthyretin-like protein  45.3 
 
 		 121 aa  108  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.427872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0207  transthyretin  49.14 
 
 		 117 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.384919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2121  hydroxyisourate hydrolase  44.74 
 
 		 116 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1934  putative transthyretin-like protein  46.55 
 
 		 117 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3611  hydroxyisourate hydrolase  43.1 
 
 		 117 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7200  putative transthyretin-like protein  48.31 
 
 		 118 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4387  transthyretin  49.12 
 
 		 116 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1102  hydroxyisourate hydrolase  47.01 
 
 		 118 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4285  transthyretin family protein  43.1 
 
 		 117 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2256  hydroxyisourate hydrolase  42.24 
 
 		 117 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3849  hydroxyisourate hydrolase  43.1 
 
 		 117 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303786  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1043  hydroxyisourate hydrolase  46.49 
 
 		 116 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  40.83 
 
 		 475 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1123  transthyretin  46.49 
 
 		 116 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.424087  normal  0.392641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1583  hydroxyisourate hydrolase  43.1 
 
 		 117 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619574  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  39.88 
 
 		 475 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3476  transthyretin  44.44 
 
 		 118 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  39.88 
 
 		 475 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.55 
 
 		 592 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  39.53 
 
 		 591 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1933  hydroxyisourate hydrolase  41.38 
 
 		 117 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0633664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  48.72 
 
 		 478 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  40.61 
 
 		 174 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  38.18 
 
 		 174 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1116  transthyretin  46.49 
 
 		 116 aa  105  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0356  transthyretin  45.3 
 
 		 118 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470514  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4619  hydroxyisourate hydrolase  43.22 
 
 		 123 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.9 
 
 		 599 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21140  hydroxyisourate hydrolase, transthyretin family protein  46.96 
 
 		 116 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2116  putative transthyretin-like protein precursor  42.24 
 
 		 117 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.851558 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2757  transthyretin  42.24 
 
 		 117 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.166058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2709  hydroxyisourate hydrolase  43.09 
 
 		 124 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0067  hypothetical protein  43.51 
 
 		 174 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4492  hydroxyisourate hydrolase  44.44 
 
 		 120 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.182838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>