113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2387 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  352  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  352  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  99.43 
 
 
174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  99.43 
 
 
174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  99.43 
 
 
174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  100 
 
 
173 aa  350  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  90.8 
 
 
174 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  85.55 
 
 
173 aa  300  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  84.39 
 
 
173 aa  300  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1950  hypothetical protein  84.39 
 
 
173 aa  300  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  83.82 
 
 
173 aa  298  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  83.82 
 
 
173 aa  298  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  83.82 
 
 
173 aa  297  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  83.24 
 
 
173 aa  297  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  83.24 
 
 
173 aa  296  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  81.76 
 
 
170 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  79.19 
 
 
173 aa  279  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  67.05 
 
 
174 aa  231  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  66.47 
 
 
174 aa  224  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  63.25 
 
 
172 aa  217  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  60.69 
 
 
173 aa  214  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  67.68 
 
 
173 aa  207  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  57.06 
 
 
190 aa  187  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3851  hypothetical protein  54.94 
 
 
171 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750718  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3667  hypothetical protein  53.09 
 
 
176 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1705  hypothetical protein  54.66 
 
 
171 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589299  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3819  hypothetical protein  53.42 
 
 
171 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0873335  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4287  hypothetical protein  54.09 
 
 
171 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44840  hypothetical protein  53.42 
 
 
171 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.165597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1581  hypothetical protein  54.09 
 
 
171 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.288278  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  53.22 
 
 
592 aa  167  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  53.71 
 
 
589 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  54.29 
 
 
592 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3613  hypothetical protein  52.2 
 
 
171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00378889  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  53.75 
 
 
176 aa  164  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1808  hypothetical protein  50 
 
 
171 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  52.57 
 
 
589 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  51.2 
 
 
167 aa  160  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  52.87 
 
 
593 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0067  hypothetical protein  51.9 
 
 
174 aa  159  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  53.94 
 
 
169 aa  158  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2708  hypothetical protein  46.82 
 
 
173 aa  156  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  51.15 
 
 
592 aa  156  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  46.82 
 
 
173 aa  154  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  49.71 
 
 
591 aa  154  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  46.06 
 
 
163 aa  152  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  48.17 
 
 
178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  51.22 
 
 
170 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5459  OHCU decarboxylase  47.37 
 
 
175 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  49.06 
 
 
171 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  48.85 
 
 
591 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  51.79 
 
 
294 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  45.2 
 
 
594 aa  147  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  50 
 
 
599 aa  140  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  43.83 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2887  OHCU decarboxylase  43.21 
 
 
166 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  49.38 
 
 
475 aa  134  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  45.14 
 
 
599 aa  134  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3347  hypothetical protein  44.58 
 
 
169 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.943196  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  43.21 
 
 
292 aa  130  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2600  hypothetical protein  41.57 
 
 
179 aa  127  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562153  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  44.17 
 
 
470 aa  127  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  46.5 
 
 
475 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  43.83 
 
 
470 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  46.5 
 
 
475 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4490  hypothetical protein  46.01 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.910632  normal  0.397544 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  42.35 
 
 
471 aa  124  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  42.24 
 
 
471 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  45.34 
 
 
482 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0035  putative uricase  41.61 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  43.64 
 
 
471 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2831  polysaccharide deacetylase  40.99 
 
 
478 aa  117  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.729324  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  42.53 
 
 
470 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49522  predicted protein  40 
 
 
299 aa  117  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.219975  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  43.03 
 
 
471 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1150  hypothetical protein  50.6 
 
 
180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.738978  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  40.99 
 
 
471 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  41.36 
 
 
470 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  41.36 
 
 
470 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  44.03 
 
 
478 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7199  hypothetical protein  41.14 
 
 
475 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  40.36 
 
 
470 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5250  OHCU decarboxylase  44.05 
 
 
289 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00421596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  41.51 
 
 
478 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  32.14 
 
 
166 aa  97.8  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03789  chitooligosaccharide deacetylase  41.22 
 
 
186 aa  92.8  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  32.12 
 
 
825 aa  91.3  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  31.33 
 
 
665 aa  89  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5814  hydroxyisourate hydrolase  36.31 
 
 
279 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  34.32 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  31.03 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  26.06 
 
 
647 aa  62.4  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  27.38 
 
 
633 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  26.79 
 
 
640 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  31.82 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  26.99 
 
 
163 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  32.86 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  30.3 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  25.76 
 
 
138 aa  53.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  27.33 
 
 
516 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>