78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02518 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  100 
 
 		 138 aa  285  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  54.74 
 
 		 139 aa  154  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  53.62 
 
 		 188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  53.28 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  47.45 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  38.06 
 
 		 197 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  36.03 
 
 		 520 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  34.81 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  34.29 
 
 		 516 aa  73.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  33.55 
 
 		 198 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  34.33 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  31.16 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  35 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  31.34 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  30.15 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  29.71 
 
 		 193 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  30.6 
 
 		 825 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  32.35 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  34.59 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2887  OHCU decarboxylase  40.62 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  30.71 
 
 		 475 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  28.99 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  30.23 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  27.27 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  30.6 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  24.43 
 
 		 174 aa  52  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  25.19 
 
 		 173 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  25.19 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  25.19 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  25.19 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  27.82 
 
 		 173 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  25.19 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  25.19 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  29.63 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  32.41 
 
 		 475 aa  50.4  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  32.41 
 
 		 475 aa  50.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  27.46 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  38.33 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4490  hypothetical protein  33.87 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.910632  normal  0.397544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  30.66 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  27.12 
 
 		 165 aa  48.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3347  hypothetical protein  29.06 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.943196  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  29.77 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  29.2 
 
 		 471 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0035  putative uricase  25.56 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  33.33 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  26.47 
 
 		 173 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5459  OHCU decarboxylase  28.79 
 
 		 175 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  30.48 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  29.7 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5814  hydroxyisourate hydrolase  32.88 
 
 		 279 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  30.84 
 
 		 482 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  27.27 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2708  hypothetical protein  28.57 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  28.46 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49522  predicted protein  28.57 
 
 		 299 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.219975  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  25.4 
 
 		 470 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3819  hypothetical protein  27.56 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0873335  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  26.52 
 
 		 170 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 		 470 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  30.7 
 
 		 470 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  25.56 
 
 		 471 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1808  hypothetical protein  29.7 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  25 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  25 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44840  hypothetical protein  27.56 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165597 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  28.35 
 
 		 471 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03789  chitooligosaccharide deacetylase  36.92 
 
 		 186 aa  41.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  25.76 
 
 		 173 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  25 
 
 		 173 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  22.14 
 
 		 173 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  25.58 
 
 		 294 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2831  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 		 478 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.729324  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3667  hypothetical protein  35.48 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  24.81 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06190  hypothetical protein  27.84 
 
 		 204 aa  40.4  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1950  hypothetical protein  24.24 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  23.36 
 
 		 172 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>