76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4869 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  100 
 
 		 169 aa  349  8.999999999999999e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  52.63 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  44.91 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  53.28 
 
 		 138 aa  145  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  42.03 
 
 		 139 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  33.33 
 
 		 520 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  36.81 
 
 		 197 aa  100  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  32.54 
 
 		 516 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  30.95 
 
 		 166 aa  94.4  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  31.33 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  32.1 
 
 		 196 aa  92  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  34.15 
 
 		 163 aa  91.7  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  33.33 
 
 		 177 aa  86.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  31.95 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  33.13 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  32.35 
 
 		 165 aa  85.5  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  30.49 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  30.59 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  28.4 
 
 		 825 aa  79.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  28.83 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  26.42 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  29.38 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  33.33 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  27.89 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  26.09 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  30.06 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  26.09 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  26.09 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  31.65 
 
 		 198 aa  60.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  22.42 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  25.44 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  25.77 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  26.55 
 
 		 591 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  25 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  25 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1407  putative OHCU decarboxylase  21.82 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1950  hypothetical protein  25.15 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  25 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  26.9 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  25.86 
 
 		 592 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  25.15 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  28.47 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  22.49 
 
 		 593 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  25.43 
 
 		 591 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  26.01 
 
 		 589 aa  49.3  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  26.99 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  26.55 
 
 		 589 aa  48.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  23.95 
 
 		 173 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  24.39 
 
 		 173 aa  47.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  26.19 
 
 		 174 aa  47.4  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  23.95 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  34.43 
 
 		 482 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  23.95 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  27.22 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  36.51 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  23.94 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  26.19 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  26.19 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  26.19 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  23.94 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  26.19 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  26.19 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  26.19 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  24.84 
 
 		 475 aa  45.1  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  26.67 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  24.4 
 
 		 294 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  27.27 
 
 		 163 aa  44.3  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2708  hypothetical protein  25.3 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  25.97 
 
 		 599 aa  42.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  25.58 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5814  hydroxyisourate hydrolase  32.79 
 
 		 279 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  28.36 
 
 		 475 aa  41.6  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  28.36 
 
 		 475 aa  41.6  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  22.62 
 
 		 592 aa  40.8  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  20.83 
 
 		 292 aa  40.8  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  22.54 
 
 		 665 aa  40.8  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>