47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2771 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  100 
 
 		 198 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  52.1 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  45 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  47.31 
 
 		 179 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  42.62 
 
 		 177 aa  118  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  45 
 
 		 193 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  44.13 
 
 		 516 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  36.13 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  39.78 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  41.9 
 
 		 520 aa  101  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  39.47 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  31.84 
 
 		 168 aa  99  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  41.99 
 
 		 196 aa  94.7  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  41.67 
 
 		 163 aa  92.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  41.11 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  34.97 
 
 		 165 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  36.07 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  34.39 
 
 		 164 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  30.94 
 
 		 169 aa  85.1  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  32.68 
 
 		 139 aa  84  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  35.91 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  34.59 
 
 		 825 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  33.99 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  33.33 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  29.35 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  29.35 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  29.35 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  26.63 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  32.57 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  26.92 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  34.76 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1407  putative OHCU decarboxylase  27.17 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  35.85 
 
 		 478 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  33.68 
 
 		 167 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  31.65 
 
 		 475 aa  49.3  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  34.65 
 
 		 169 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  31.65 
 
 		 475 aa  49.3  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2708  hypothetical protein  32.5 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  30.85 
 
 		 475 aa  45.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  26.8 
 
 		 163 aa  45.1  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  31.46 
 
 		 166 aa  44.7  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  28.24 
 
 		 471 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  30.77 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  36.11 
 
 		 478 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  31.37 
 
 		 294 aa  42.4  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  32.79 
 
 		 470 aa  42.4  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  28.76 
 
 		 178 aa  41.2  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>