68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0114 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  100 
 
 		 193 aa  374  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  47.8 
 
 		 825 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  45.96 
 
 		 231 aa  128  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  45.68 
 
 		 166 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  47.53 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  47.83 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  46.11 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  43.83 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  43.83 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  45.45 
 
 		 166 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  40.12 
 
 		 165 aa  104  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  41.38 
 
 		 516 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  45.45 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  38.65 
 
 		 177 aa  99.8  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  42.07 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  40.12 
 
 		 165 aa  99  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  40.99 
 
 		 520 aa  98.2  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  43.04 
 
 		 169 aa  97.8  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  44.67 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  48.05 
 
 		 179 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  46.15 
 
 		 164 aa  89  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  31.9 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  31.95 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  32.28 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  32.08 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  32.28 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  30.67 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  29.38 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  32.09 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1407  putative OHCU decarboxylase  30.06 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  29.71 
 
 		 138 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  34.95 
 
 		 478 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  33.64 
 
 		 478 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  30.87 
 
 		 167 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  35.64 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  26.32 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  32 
 
 		 470 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  32 
 
 		 470 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  31 
 
 		 471 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  28.28 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  25.81 
 
 		 475 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  26.61 
 
 		 475 aa  46.2  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  26.61 
 
 		 475 aa  46.2  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 173 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  26.06 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  32.33 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7199  hypothetical protein  31.15 
 
 		 475 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  24.26 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  26.44 
 
 		 599 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3851  hypothetical protein  24.22 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750718  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  28.16 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3613  hypothetical protein  24.22 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00378889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1581  hypothetical protein  24.22 
 
 		 171 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.288278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 		 470 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  26.35 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4287  hypothetical protein  24.22 
 
 		 171 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2887  OHCU decarboxylase  29 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  25.9 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  28.68 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  24.86 
 
 		 589 aa  42.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  25.75 
 
 		 173 aa  42  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5459  OHCU decarboxylase  28.14 
 
 		 175 aa  41.6  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  27.4 
 
 		 173 aa  41.2  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>