89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2427 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  54.74 
 
 		 138 aa  154  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  42.03 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  45.26 
 
 		 168 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  42.86 
 
 		 188 aa  110  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  34.31 
 
 		 516 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  34.56 
 
 		 520 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  32.03 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  32.56 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  37.59 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  33.83 
 
 		 177 aa  70.5  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  33.59 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  33.82 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  32.09 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  28.47 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  31.82 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  33.59 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  28.46 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  27.56 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  34.07 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  33.33 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  28.91 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  31.16 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  29.85 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  34.81 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  30.36 
 
 		 825 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  28.03 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  28.03 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  26.15 
 
 		 174 aa  52.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  26.72 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  29.46 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  27.48 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  26.15 
 
 		 173 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  26.15 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  26.15 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  32 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  26.15 
 
 		 174 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  26.15 
 
 		 174 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  26.15 
 
 		 174 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  25.95 
 
 		 173 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  25.95 
 
 		 173 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  33.66 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0035  putative uricase  25.76 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2887  OHCU decarboxylase  31.82 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  25.95 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  25.19 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  29.55 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2708  hypothetical protein  36.27 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  30.77 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  24.46 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  24.46 
 
 		 173 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1950  hypothetical protein  24.43 
 
 		 173 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  24.46 
 
 		 173 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  27.2 
 
 		 475 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  29.27 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  30.56 
 
 		 475 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  30.33 
 
 		 471 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  31.06 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  24.62 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  23.66 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  30.56 
 
 		 475 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3613  hypothetical protein  30.36 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00378889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  23.85 
 
 		 173 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 471 aa  45.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1705  hypothetical protein  31.37 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 470 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  30.39 
 
 		 478 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  32 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3347  hypothetical protein  31.62 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.943196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4287  hypothetical protein  29.46 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1581  hypothetical protein  29.46 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.288278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  27 
 
 		 190 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1808  hypothetical protein  30 
 
 		 171 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 470 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3851  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750718  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  27.5 
 
 		 592 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3819  hypothetical protein  29.09 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0873335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44840  hypothetical protein  29.09 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165597 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4490  hypothetical protein  32.17 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.910632  normal  0.397544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3667  hypothetical protein  31.07 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  29.71 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  30.3 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5814  hydroxyisourate hydrolase  29.73 
 
 		 279 aa  42.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  30.1 
 
 		 478 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  35.71 
 
 		 294 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  28.79 
 
 		 170 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2831  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 		 478 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.729324  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 471 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 471 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>