86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2960 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  100 
 
 		 169 aa  322  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  47.5 
 
 		 825 aa  131  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  48.43 
 
 		 163 aa  130  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  42.94 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  45.28 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  46.95 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  41.82 
 
 		 165 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  43.04 
 
 		 193 aa  110  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  42.17 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  40 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  44.81 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  40.38 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  40.49 
 
 		 165 aa  94.4  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  42.75 
 
 		 197 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  44.85 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  38.51 
 
 		 182 aa  84.3  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  29.41 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  38.36 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  40.23 
 
 		 516 aa  78.6  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  34.91 
 
 		 520 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  30.06 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  39.1 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  28.99 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  37.12 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  37.12 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  37.12 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  31.21 
 
 		 589 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3613  hypothetical protein  35.42 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00378889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3851  hypothetical protein  29.41 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750718  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  30.64 
 
 		 589 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4287  hypothetical protein  29.41 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1581  hypothetical protein  29.41 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.288278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  30.95 
 
 		 592 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  41.35 
 
 		 482 aa  58.2  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  32.32 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2600  hypothetical protein  31.18 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  34.38 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  30.66 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  27.61 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  40.19 
 
 		 478 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  31.21 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1808  hypothetical protein  26.32 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  34.69 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  28.24 
 
 		 594 aa  52  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  29.94 
 
 		 591 aa  52  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44840  hypothetical protein  28.16 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  25.77 
 
 		 172 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  25.62 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  34.88 
 
 		 471 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1705  hypothetical protein  32.29 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  28.9 
 
 		 592 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  31.63 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  32.14 
 
 		 592 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3667  hypothetical protein  31.63 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3819  hypothetical protein  27.43 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0873335  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  33.65 
 
 		 470 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  37.38 
 
 		 478 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  33.65 
 
 		 470 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  31.65 
 
 		 139 aa  48.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  29.69 
 
 		 173 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2887  OHCU decarboxylase  33.33 
 
 		 166 aa  47.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  29.69 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  29.69 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  31.01 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  30.28 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  29.14 
 
 		 593 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  24.84 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  28.92 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  26.09 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  35.64 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  27.66 
 
 		 190 aa  44.7  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  30.99 
 
 		 599 aa  44.7  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  27.65 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  28.15 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 		 470 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2708  hypothetical protein  26.54 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0067  hypothetical protein  34.19 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  25.83 
 
 		 591 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  26.28 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  26.88 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  26.88 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  26.88 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  33.01 
 
 		 470 aa  41.6  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  25.47 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  25.47 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  25.47 
 
 		 173 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.523648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>