76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0720 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  100 
 
 		 182 aa  357  5e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  45.68 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  42.86 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  46.06 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  40.12 
 
 		 165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  43.83 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  34.91 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  43.98 
 
 		 825 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  41.14 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  41.67 
 
 		 197 aa  104  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  43.11 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  41.28 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  41.36 
 
 		 166 aa  98.6  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  41.67 
 
 		 165 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  46.75 
 
 		 179 aa  95.5  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  37.85 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  39.64 
 
 		 166 aa  86.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  31.95 
 
 		 169 aa  85.9  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  40.38 
 
 		 198 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  34.17 
 
 		 516 aa  85.1  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  36.14 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  37.27 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  35.32 
 
 		 520 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  37.89 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  31.33 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  31.33 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  31.33 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  34.9 
 
 		 475 aa  62.8  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  29.52 
 
 		 172 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  28.47 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  32.35 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  29.41 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  26.79 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  28.66 
 
 		 475 aa  53.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  28.4 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1407  putative OHCU decarboxylase  28.92 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  28.66 
 
 		 475 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  29.82 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  26.19 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  28.99 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  27.81 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  29.17 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  28.57 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  26.19 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  30.46 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  27.88 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  30.46 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  30.46 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  29.17 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  28.49 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  26.79 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2708  hypothetical protein  26.29 
 
 		 173 aa  45.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  27.27 
 
 		 167 aa  45.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  27.73 
 
 		 166 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2600  hypothetical protein  27.98 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562153  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3347  hypothetical protein  28.28 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.943196  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  33.11 
 
 		 471 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  28.32 
 
 		 471 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  26.04 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  26.04 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1950  hypothetical protein  26.59 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  25.15 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  25.15 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 470 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  26.59 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  25.15 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  23.95 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 		 470 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  29.73 
 
 		 478 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5814  hydroxyisourate hydrolase  42.11 
 
 		 279 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  26.19 
 
 		 592 aa  42.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  30.48 
 
 		 482 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  31.15 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  28.82 
 
 		 169 aa  41.6  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  28.41 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>