More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2965 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  59.18 
 
 		 825 aa  728    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  60.86 
 
 		 665 aa  754    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  100 
 
 		 640 aa  1254    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  65.65 
 
 		 633 aa  793    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  52.32 
 
 		 647 aa  599  1e-170  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  50.11 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  51.55 
 
 		 431 aa  389  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  48.67 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  45.87 
 
 		 457 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  45.64 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  45.87 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  45.87 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  45.95 
 
 		 482 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  45.43 
 
 		 468 aa  363  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  43.45 
 
 		 495 aa  363  6e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  44.75 
 
 		 460 aa  362  9e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  45.41 
 
 		 458 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  45.41 
 
 		 458 aa  360  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  45.18 
 
 		 458 aa  360  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  45.69 
 
 		 446 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  43.88 
 
 		 487 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  45.27 
 
 		 469 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  45.41 
 
 		 457 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  44.72 
 
 		 479 aa  351  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  44.72 
 
 		 457 aa  350  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  44.72 
 
 		 457 aa  350  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2107  xanthine permease  42.19 
 
 		 495 aa  349  8e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439445  normal  0.198609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  45.5 
 
 		 469 aa  347  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  43.17 
 
 		 463 aa  347  5e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  43.58 
 
 		 444 aa  344  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1277  uracil-xanthine permease  42.05 
 
 		 496 aa  344  4e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1307  xanthine permease  46.2 
 
 		 499 aa  343  5.999999999999999e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.225701  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  44.57 
 
 		 471 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  40.98 
 
 		 463 aa  340  7e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  42.69 
 
 		 440 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  42.69 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  42.45 
 
 		 440 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  42.69 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  42.45 
 
 		 440 aa  336  9e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  45.39 
 
 		 468 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  42.45 
 
 		 440 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  42.45 
 
 		 440 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  42.45 
 
 		 440 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  43.99 
 
 		 489 aa  335  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  42.45 
 
 		 440 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  42.45 
 
 		 440 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  42.69 
 
 		 440 aa  334  3e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1034  xanthine permease  40.53 
 
 		 495 aa  333  6e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  43.2 
 
 		 465 aa  333  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  41.81 
 
 		 494 aa  332  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  42.73 
 
 		 482 aa  332  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  42.73 
 
 		 482 aa  332  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  42.73 
 
 		 525 aa  332  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  42.73 
 
 		 482 aa  332  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1141  xanthine permease  42.42 
 
 		 490 aa  332  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  42.73 
 
 		 482 aa  332  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  42.73 
 
 		 482 aa  332  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4724  xanthine permease  42.55 
 
 		 518 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0102171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1113  uracil-xanthine permease  40.53 
 
 		 495 aa  331  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  42.73 
 
 		 482 aa  332  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  44.78 
 
 		 469 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  44.55 
 
 		 469 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  42.49 
 
 		 525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3917  uracil-xanthine permease  43.51 
 
 		 493 aa  328  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  41.88 
 
 		 466 aa  326  9e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  42.05 
 
 		 457 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  41.55 
 
 		 442 aa  324  3e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  41.65 
 
 		 505 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  42.79 
 
 		 465 aa  321  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1828  uracil-xanthine permease  41.67 
 
 		 442 aa  319  9e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  41.65 
 
 		 466 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  42.27 
 
 		 475 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  42.27 
 
 		 475 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  41.65 
 
 		 466 aa  317  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  41.36 
 
 		 503 aa  316  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  43.76 
 
 		 435 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  41.07 
 
 		 505 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  41.29 
 
 		 493 aa  313  5.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0633  xanthine/uracil transporter  41.97 
 
 		 457 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  40.85 
 
 		 505 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  40.62 
 
 		 505 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  40.64 
 
 		 501 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3209  xanthine permease  41.86 
 
 		 501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  41.86 
 
 		 500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  41.42 
 
 		 566 aa  308  3e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3343  xanthine permease  43.56 
 
 		 469 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3668  xanthine permease  43.79 
 
 		 469 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0396635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  40.09 
 
 		 452 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  41.26 
 
 		 506 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3292  uracil-xanthine permease  43.81 
 
 		 463 aa  303  7.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  43.09 
 
 		 463 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  41.1 
 
 		 449 aa  301  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  39.51 
 
 		 455 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  41.49 
 
 		 497 aa  300  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3606  xanthine permease  41.74 
 
 		 457 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  39.51 
 
 		 455 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5248  xanthine permease  44.39 
 
 		 466 aa  300  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  39.82 
 
 		 509 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7137  xanthine permease  41.88 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0536  xanthine/uracil permease  40.05 
 
 		 448 aa  298  2e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>