More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3428 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  72.33 
 
 
505 aa  691    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  72.54 
 
 
505 aa  680    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  71.99 
 
 
501 aa  684    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  71.7 
 
 
505 aa  674    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  72.63 
 
 
506 aa  685    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  72.97 
 
 
509 aa  690    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  70.66 
 
 
493 aa  693    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0967  uracil-xanthine permease  68.42 
 
 
496 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3209  xanthine permease  93.21 
 
 
501 aa  883    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  71.91 
 
 
505 aa  674    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  71.69 
 
 
503 aa  696    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  66.67 
 
 
497 aa  644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  74.68 
 
 
485 aa  677    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  100 
 
 
500 aa  983    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  67.63 
 
 
566 aa  639    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  54.06 
 
 
487 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0717  xanthine permease  49.35 
 
 
502 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  48.9 
 
 
458 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  50.12 
 
 
489 aa  411  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  47.74 
 
 
460 aa  403  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  50.7 
 
 
459 aa  402  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  43.91 
 
 
482 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  46.78 
 
 
431 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  45.51 
 
 
457 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  45.27 
 
 
457 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  46.19 
 
 
458 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  43.95 
 
 
468 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  44.86 
 
 
458 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  44.86 
 
 
458 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  45.08 
 
 
458 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  44.64 
 
 
457 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  44.64 
 
 
457 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  43.86 
 
 
479 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  44.06 
 
 
455 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  44.64 
 
 
458 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  43.84 
 
 
455 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  45.74 
 
 
469 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  44.64 
 
 
458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  44.14 
 
 
444 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  44.39 
 
 
469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  43.24 
 
 
475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  43.24 
 
 
475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  43.83 
 
 
471 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  44.97 
 
 
469 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  44.87 
 
 
469 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  40.32 
 
 
825 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  45.23 
 
 
452 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1141  xanthine permease  42.49 
 
 
490 aa  346  5e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  44.52 
 
 
468 aa  345  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  42.49 
 
 
446 aa  342  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  41.28 
 
 
495 aa  340  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  43.55 
 
 
451 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  43.92 
 
 
465 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  43.32 
 
 
451 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  43.09 
 
 
451 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  44.24 
 
 
451 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  41.36 
 
 
633 aa  331  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  42.96 
 
 
457 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  42.86 
 
 
463 aa  324  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2107  xanthine permease  38.2 
 
 
495 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439445  normal  0.198609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  40.32 
 
 
465 aa  323  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3917  uracil-xanthine permease  41.56 
 
 
493 aa  322  7e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51079  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  39.75 
 
 
494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1034  xanthine permease  38.51 
 
 
495 aa  318  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581901  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  39.19 
 
 
466 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1277  uracil-xanthine permease  38.46 
 
 
496 aa  318  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  39.19 
 
 
466 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  38.65 
 
 
647 aa  317  4e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5248  xanthine permease  42.11 
 
 
466 aa  316  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0121197 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  40.27 
 
 
463 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  41.95 
 
 
466 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1113  uracil-xanthine permease  38.3 
 
 
495 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4724  xanthine permease  41.56 
 
 
518 aa  314  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0102171  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0633  xanthine/uracil transporter  38.16 
 
 
457 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757735  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  41.8 
 
 
640 aa  311  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  39.09 
 
 
482 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  39.09 
 
 
482 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  39.09 
 
 
482 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  39.09 
 
 
482 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  39.09 
 
 
482 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  39.09 
 
 
482 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  39.09 
 
 
525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3606  xanthine permease  38.38 
 
 
457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7137  xanthine permease  39.29 
 
 
446 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  38.86 
 
 
525 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1307  xanthine permease  40.12 
 
 
499 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.225701  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  40.55 
 
 
463 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3433  xanthine/uracil permease  40.24 
 
 
451 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  38.34 
 
 
665 aa  297  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  39.3 
 
 
451 aa  296  5e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3292  uracil-xanthine permease  42.13 
 
 
463 aa  295  9e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967032  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  39.09 
 
 
449 aa  289  9e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3080  xanthine/uracil permease  39 
 
 
449 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230022  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1266  xanthine/uracil permease  39.77 
 
 
427 aa  276  5e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144889  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2128  uracil-xanthine permease  37.87 
 
 
450 aa  276  6e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344536  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3343  xanthine permease  40.32 
 
 
469 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3668  xanthine permease  40.09 
 
 
469 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0396635  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  36.76 
 
 
440 aa  273  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  36.27 
 
 
440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  36.52 
 
 
440 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>