More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2911 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  65.11 
 
 		 495 aa  660    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2107  xanthine permease  65.52 
 
 		 495 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439445  normal  0.198609 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  100 
 
 		 494 aa  962    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1113  uracil-xanthine permease  67 
 
 		 495 aa  647    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1034  xanthine permease  67 
 
 		 495 aa  647    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581901  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1277  uracil-xanthine permease  70.02 
 
 		 496 aa  680    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1141  xanthine permease  63.95 
 
 		 490 aa  616  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3917  uracil-xanthine permease  66.95 
 
 		 493 aa  605  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0781  putative permease transmembrane protein  61.29 
 
 		 533 aa  587  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.654089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1307  xanthine permease  63.92 
 
 		 499 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.225701  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  58.93 
 
 		 466 aa  519  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  59.34 
 
 		 465 aa  521  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  58.93 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  59.21 
 
 		 465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5248  xanthine permease  61.97 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3292  uracil-xanthine permease  57.81 
 
 		 463 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  55.62 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  53.2 
 
 		 457 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  53.13 
 
 		 479 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  53.13 
 
 		 457 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  53.13 
 
 		 457 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  53.59 
 
 		 457 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  53.39 
 
 		 458 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  53.8 
 
 		 458 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  53.39 
 
 		 458 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  53.8 
 
 		 458 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  53.72 
 
 		 469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  52.77 
 
 		 458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  53.18 
 
 		 458 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  50.81 
 
 		 468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  54.12 
 
 		 471 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  53 
 
 		 469 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  54.27 
 
 		 468 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  50.81 
 
 		 482 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  52.59 
 
 		 469 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  53.31 
 
 		 469 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  49.59 
 
 		 457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  48.65 
 
 		 482 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  48.65 
 
 		 482 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  48.65 
 
 		 482 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  48.65 
 
 		 525 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  48.65 
 
 		 482 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  48.65 
 
 		 482 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  48.65 
 
 		 482 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  48.45 
 
 		 525 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  48.24 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  46.77 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  49.25 
 
 		 475 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  49.25 
 
 		 475 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  49.37 
 
 		 449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  45.67 
 
 		 431 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  45.38 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  45.38 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  46.07 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  47.12 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  46.19 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  45.55 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  47.33 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  46.01 
 
 		 452 aa  365  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  43.61 
 
 		 489 aa  365  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  47.05 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  43 
 
 		 458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  43.52 
 
 		 444 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0633  xanthine/uracil transporter  41.26 
 
 		 457 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3606  xanthine permease  41.63 
 
 		 457 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  40.66 
 
 		 460 aa  339  8e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7137  xanthine permease  41.18 
 
 		 446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  44.04 
 
 		 459 aa  336  7e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  41.38 
 
 		 501 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  41.26 
 
 		 503 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  40.89 
 
 		 825 aa  332  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  41.34 
 
 		 487 aa  332  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  42.46 
 
 		 633 aa  326  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  40.17 
 
 		 440 aa  323  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  40.17 
 
 		 440 aa  324  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  40.17 
 
 		 440 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  40.17 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  40.17 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  40.17 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  40.17 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  40.17 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  40.17 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  39.96 
 
 		 440 aa  323  6e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  40.53 
 
 		 509 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  41.81 
 
 		 640 aa  322  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  39.23 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3080  xanthine/uracil permease  40.73 
 
 		 449 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230022  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  40.21 
 
 		 505 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3433  xanthine/uracil permease  39.54 
 
 		 451 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  41.21 
 
 		 506 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0447  uracil-xanthine permease  37.74 
 
 		 422 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218584  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0436  uracil-xanthine permease  37.74 
 
 		 422 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  38.76 
 
 		 665 aa  311  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  39.92 
 
 		 485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  39.79 
 
 		 505 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  39.58 
 
 		 505 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  38.29 
 
 		 647 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  37.79 
 
 		 497 aa  306  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  38.11 
 
 		 493 aa  306  6e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  38.82 
 
 		 566 aa  306  7e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>