More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4505 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  99.41 
 
 
505 aa  993    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0967  uracil-xanthine permease  78.36 
 
 
496 aa  715    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  98.61 
 
 
505 aa  989    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  82.47 
 
 
506 aa  783    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  95.84 
 
 
505 aa  959    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  82.5 
 
 
509 aa  814    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  74.49 
 
 
493 aa  723    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3209  xanthine permease  72.11 
 
 
501 aa  670    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  66.6 
 
 
497 aa  643    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  100 
 
 
505 aa  999    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  78.09 
 
 
503 aa  780    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  82.95 
 
 
485 aa  780    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  71.91 
 
 
500 aa  667    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  75.55 
 
 
501 aa  744    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  61.07 
 
 
566 aa  584  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  52.91 
 
 
487 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0717  xanthine permease  48.45 
 
 
502 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  49.78 
 
 
459 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  50 
 
 
489 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  49.66 
 
 
458 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  47.72 
 
 
460 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  46.65 
 
 
482 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  48.43 
 
 
431 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  45.16 
 
 
468 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  46.22 
 
 
469 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  45.56 
 
 
469 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  44.98 
 
 
475 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  44.98 
 
 
475 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  46.01 
 
 
444 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  46.12 
 
 
458 aa  355  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  45.45 
 
 
457 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  45.13 
 
 
458 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  45.58 
 
 
458 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  45.13 
 
 
458 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  45.35 
 
 
458 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  44.8 
 
 
455 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  45.35 
 
 
458 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  44.57 
 
 
455 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  44.25 
 
 
479 aa  350  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  44.47 
 
 
457 aa  349  6e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  44.25 
 
 
457 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  44.25 
 
 
457 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  45.15 
 
 
468 aa  348  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  44.59 
 
 
469 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  42.08 
 
 
825 aa  347  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  45.66 
 
 
465 aa  345  8.999999999999999e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  45.05 
 
 
451 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  45.05 
 
 
451 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  43.72 
 
 
471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  44.81 
 
 
451 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  44.04 
 
 
452 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  45.48 
 
 
446 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  44.87 
 
 
469 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  44.58 
 
 
451 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  41.03 
 
 
495 aa  339  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  41.61 
 
 
457 aa  339  8e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  44.09 
 
 
633 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  42.24 
 
 
463 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5248  xanthine permease  43.12 
 
 
466 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0121197 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2107  xanthine permease  39.12 
 
 
495 aa  323  6e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439445  normal  0.198609 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0633  xanthine/uracil transporter  39.64 
 
 
457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757735  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1141  xanthine permease  39.83 
 
 
490 aa  320  6e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  39.01 
 
 
466 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  40.05 
 
 
466 aa  318  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  39.02 
 
 
465 aa  317  4e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  41 
 
 
482 aa  316  5e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  41 
 
 
482 aa  316  5e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  41 
 
 
482 aa  316  5e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  41 
 
 
482 aa  316  5e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  41 
 
 
482 aa  316  5e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  41 
 
 
482 aa  316  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3917  uracil-xanthine permease  40.51 
 
 
493 aa  316  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51079  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  41 
 
 
525 aa  316  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1277  uracil-xanthine permease  38.48 
 
 
496 aa  315  9e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7137  xanthine permease  39.49 
 
 
446 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1034  xanthine permease  39 
 
 
495 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581901  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  39.58 
 
 
494 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  40.77 
 
 
525 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1113  uracil-xanthine permease  39 
 
 
495 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3606  xanthine permease  40.19 
 
 
457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  40.72 
 
 
647 aa  310  5.9999999999999995e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  40.28 
 
 
463 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  41.31 
 
 
449 aa  307  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3292  uracil-xanthine permease  43.17 
 
 
463 aa  307  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967032  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3433  xanthine/uracil permease  41.55 
 
 
451 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  41.07 
 
 
640 aa  306  6e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4724  xanthine permease  41.02 
 
 
518 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0102171  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  42.2 
 
 
466 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  40.69 
 
 
463 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3080  xanthine/uracil permease  41.09 
 
 
449 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1307  xanthine permease  38.99 
 
 
499 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.225701  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2128  uracil-xanthine permease  40.33 
 
 
450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344536  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1085  xanthine permease  38.93 
 
 
424 aa  279  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  37.27 
 
 
451 aa  278  2e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  37.08 
 
 
665 aa  276  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1266  xanthine/uracil permease  38.93 
 
 
427 aa  277  4e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144889  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0536  xanthine/uracil permease  39.22 
 
 
448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490682  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  36.32 
 
 
442 aa  275  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  35.86 
 
 
452 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  35.86 
 
 
452 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>