More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08240 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  100 
 
 		 566 aa  1096    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  67.63 
 
 		 500 aa  618  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3209  xanthine permease  65.63 
 
 		 501 aa  600  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  61.07 
 
 		 505 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  60.98 
 
 		 501 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  61.93 
 
 		 503 aa  579  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  60.45 
 
 		 493 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  60.45 
 
 		 505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  60.2 
 
 		 506 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  60.45 
 
 		 505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  60.25 
 
 		 505 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  61.33 
 
 		 509 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  61.19 
 
 		 485 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  58.51 
 
 		 497 aa  548  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0967  uracil-xanthine permease  58.51 
 
 		 496 aa  538  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  49.37 
 
 		 487 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  48.48 
 
 		 489 aa  375  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  46.64 
 
 		 458 aa  360  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  45.56 
 
 		 460 aa  360  4e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  47.06 
 
 		 459 aa  357  3.9999999999999996e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0717  xanthine permease  44.44 
 
 		 502 aa  352  8e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  43.67 
 
 		 444 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  44.87 
 
 		 455 aa  349  9e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  44.87 
 
 		 455 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  43.36 
 
 		 825 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  46.12 
 
 		 452 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  45.54 
 
 		 451 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  45.31 
 
 		 451 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  44.82 
 
 		 431 aa  338  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  45.54 
 
 		 451 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  45.31 
 
 		 451 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  41.55 
 
 		 446 aa  330  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  43.95 
 
 		 457 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  43.72 
 
 		 479 aa  329  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  42.48 
 
 		 468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  42.04 
 
 		 482 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  43.49 
 
 		 457 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  43.49 
 
 		 457 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  44.88 
 
 		 457 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  44.88 
 
 		 458 aa  324  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  44.65 
 
 		 458 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  44.65 
 
 		 458 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  42.51 
 
 		 475 aa  323  6e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  42.51 
 
 		 475 aa  323  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  42.98 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  42.98 
 
 		 458 aa  319  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3917  uracil-xanthine permease  42.42 
 
 		 493 aa  318  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  42.69 
 
 		 469 aa  317  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  43.61 
 
 		 458 aa  316  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  41.59 
 
 		 469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  41.81 
 
 		 469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  39.53 
 
 		 495 aa  313  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  41.15 
 
 		 468 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  42.57 
 
 		 471 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2107  xanthine permease  38.82 
 
 		 495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439445  normal  0.198609 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1141  xanthine permease  40.04 
 
 		 490 aa  306  5.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  40.88 
 
 		 457 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  38.82 
 
 		 494 aa  306  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1277  uracil-xanthine permease  37.26 
 
 		 496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  40.92 
 
 		 647 aa  303  5.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  40 
 
 		 482 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  40 
 
 		 482 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  40 
 
 		 482 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  40 
 
 		 482 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  40 
 
 		 482 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  40.56 
 
 		 525 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  40 
 
 		 482 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  39.88 
 
 		 633 aa  301  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1034  xanthine permease  38.48 
 
 		 495 aa  302  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  42.22 
 
 		 469 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  40.33 
 
 		 525 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1113  uracil-xanthine permease  38.48 
 
 		 495 aa  300  7e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  40.49 
 
 		 466 aa  297  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  40.49 
 
 		 466 aa  297  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0633  xanthine/uracil transporter  39.41 
 
 		 457 aa  296  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4724  xanthine permease  40.76 
 
 		 518 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0102171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  40.98 
 
 		 465 aa  294  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  41.42 
 
 		 640 aa  293  6e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  41.46 
 
 		 465 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7137  xanthine permease  39.53 
 
 		 446 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  41.43 
 
 		 463 aa  291  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  40.05 
 
 		 466 aa  291  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3606  xanthine permease  39.77 
 
 		 457 aa  290  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3080  xanthine/uracil permease  40 
 
 		 449 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230022  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  39.86 
 
 		 463 aa  281  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5248  xanthine permease  40.72 
 
 		 466 aa  279  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2128  uracil-xanthine permease  40.05 
 
 		 450 aa  279  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  39.63 
 
 		 463 aa  277  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1307  xanthine permease  40.47 
 
 		 499 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.225701  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1085  xanthine permease  39.17 
 
 		 424 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  36.58 
 
 		 442 aa  269  1e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3433  xanthine/uracil permease  38.41 
 
 		 451 aa  266  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  37.18 
 
 		 665 aa  265  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  36.6 
 
 		 449 aa  262  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1266  xanthine/uracil permease  38 
 
 		 427 aa  261  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144889  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0536  xanthine/uracil permease  36.87 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  35.27 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  36.56 
 
 		 440 aa  261  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  36.32 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  36.32 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>