139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2070 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2070  Transthyretin  100 
 
 		 109 aa  211  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2961  hydroxyisourate hydrolase  55.45 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0113  hydroxyisourate hydrolase  54.63 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4738  hydroxyisourate hydrolase  57.66 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08260  hydroxyisourate hydrolase  50.88 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.700555  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1143  transthyretin  52.68 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.178877  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5277  transthyretin  54.63 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1824  hydroxyisourate hydrolase  50.45 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2537  hydroxyisourate hydrolase  54.05 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2772  putative transthyretin-like protein precursor  56.07 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.043163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3733  transthyretin  48.72 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0719  hydroxyisourate hydrolase  48.31 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0101  transthyretin  46.9 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.757339  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0251  hydroxyisourate hydrolase  47.5 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0063  transthyretin  41.23 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3721  hydroxyisourate hydrolase  47.46 
 
 		 115 aa  84.3  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2062  hydroxyisourate hydrolase  53.27 
 
 		 98 aa  83.6  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.268845  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2428  transthyretin  44.95 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02519  Transthyretin  42.98 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03210  conserved hypothetical protein  38.05 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0939  transthyretin  42.98 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0200  transthyretin  40.71 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0011  hydroxyisourate hydrolase  39.47 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2749  transthyretin family protein  39.13 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000377229  normal  0.260044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01885  hypothetical protein  39.13 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1681  hydroxyisourate hydrolase  39.13 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000559452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3128  hydroxyisourate hydrolase  43.86 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.041353  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01875  hypothetical protein  39.13 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000307569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2071  transthyretin family protein  39.13 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.60516e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2201  transthyretin family protein  39.13 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1675  hydroxyisourate hydrolase  39.13 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018608  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1215  transthyretin family protein  39.13 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000382431  normal  0.571702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2064  hydroxyisourate hydrolase  46.61 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1192  hydroxyisourate hydrolase  39.47 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1207  hydroxyisourate hydrolase  39.47 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1056  hydroxyisourate hydrolase  39.47 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1172  hydroxyisourate hydrolase  39.47 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0913  transthyretin family protein  38.26 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000480656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1783  hydroxyisourate hydrolase  45.83 
 
 		 115 aa  76.6  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.176528 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1161  hydroxyisourate hydrolase  39.47 
 
 		 136 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1745  hydroxyisourate hydrolase  47.06 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3455  hydroxyisourate hydrolase  45.61 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0356  transthyretin  44.92 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470514  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0885  transthyretin  42.74 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0621325  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4870  hypothetical protein  37.93 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2434  transthyretin  42.74 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1390  hydroxyisourate hydrolase  42.98 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177512  normal  0.143867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6773  hydroxyisourate hydrolase  40.52 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0842  transthyretin  46.28 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3148  hydroxyisourate hydrolase  39.83 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300279  normal  0.943913 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2072  transthyretin family protein  44.17 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2527  putative purine catabolism-related protein  41.88 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0546176  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2383  hydroxyisourate hydrolase  41.88 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.514314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2425  hydroxyisourate hydrolase  41.88 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2324  hydroxyisourate hydrolase  41.03 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.511264  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0235  hydroxyisourate hydrolase  32.17 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3036  transthyretin  39.17 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44820  putative transthyretin family protein  37.5 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal  0.119551 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4387  transthyretin  41.23 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5679  transthyretin  45.3 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3611  hydroxyisourate hydrolase  39.5 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  41.03 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4285  transthyretin family protein  37.7 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1933  hydroxyisourate hydrolase  40.17 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0633664 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0779  putative purine catabolism-related protein  42.5 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1583  hydroxyisourate hydrolase  37.7 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3816  hydroxyisourate hydrolase  36.67 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3849  hydroxyisourate hydrolase  37.7 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303786  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1346  hydroxyisourate hydrolase  40.34 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1810  transthyretin  38.52 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1934  putative transthyretin-like protein  40.17 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3570  hydroxyisourate hydrolase  38.6 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.778424  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3340  hydroxyisourate hydrolase  38.14 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2709  hydroxyisourate hydrolase  36.22 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2782  hydroxyisourate hydrolase  51.38 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.100249  hitchhiker  0.0000124346 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2116  putative transthyretin-like protein precursor  40.17 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.851558 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3915  transthyretin  35.71 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.471177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1116  transthyretin  39.47 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1123  transthyretin  40.35 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.424087  normal  0.392641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1043  hydroxyisourate hydrolase  40.35 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2757  transthyretin  37.82 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.166058 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1152  transthyretin  43.7 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.242514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21140  hydroxyisourate hydrolase, transthyretin family protein  38.98 
 
 		 116 aa  67  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2609  transthyretin  38.46 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.846937 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2884  hydroxyisourate hydrolase  38.98 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.11874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2121  hydroxyisourate hydrolase  38.6 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1294  hydroxyisourate hydrolase  39.32 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2256  hydroxyisourate hydrolase  39.32 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0815  transthyretin-like protein  33.62 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0576274  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0738  transthyretin-like protein  33.62 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.543928  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1708  transthyretin  37.7 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.187412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6121  transthyretin  41.88 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1957  transthyretin  41.88 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1981  hydroxyisourate hydrolase  41.88 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1872  hydroxyisourate hydrolase  41.03 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  0.0980153 
 
 
-
 
NC_004310  BR0508  hypothetical protein  41.53 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5268  transthyretin  41.03 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1945  transthyretin  41.03 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0511  hydroxyisourate hydrolase  40.83 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0450  hydroxyisourate hydrolase  36.75 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>