139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3570 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3570  hydroxyisourate hydrolase  100 
 
 		 110 aa  224  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.778424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0939  transthyretin  56.76 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0719  hydroxyisourate hydrolase  47.32 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2961  hydroxyisourate hydrolase  47.27 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3455  hydroxyisourate hydrolase  41.82 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2772  putative transthyretin-like protein precursor  50.46 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.043163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0200  transthyretin  38.18 
 
 		 136 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3733  transthyretin  43.24 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5277  transthyretin  48.62 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1192  hydroxyisourate hydrolase  38.74 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1207  hydroxyisourate hydrolase  38.74 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1056  hydroxyisourate hydrolase  38.74 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1172  hydroxyisourate hydrolase  38.74 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08260  hydroxyisourate hydrolase  41.44 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.700555  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1161  hydroxyisourate hydrolase  38.74 
 
 		 136 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0101  transthyretin  39.09 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.757339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4738  hydroxyisourate hydrolase  46.36 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0237  hydroxyisourate hydrolase  41.67 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6773  hydroxyisourate hydrolase  37.5 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1824  hydroxyisourate hydrolase  42.34 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3128  hydroxyisourate hydrolase  44.14 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.041353  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1933  hydroxyisourate hydrolase  42.86 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0633664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2324  hydroxyisourate hydrolase  43.22 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.511264  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2527  putative purine catabolism-related protein  43.22 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0546176  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1555  transthyretin-like protein  43.22 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552439  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2428  transthyretin  37.61 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0450  hydroxyisourate hydrolase  36.61 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0913  transthyretin family protein  34.23 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000480656  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2256  hydroxyisourate hydrolase  39.83 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.894815 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1681  hydroxyisourate hydrolase  34.23 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000559452  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01885  hypothetical protein  34.23 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2116  putative transthyretin-like protein precursor  41.53 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.851558 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01875  hypothetical protein  34.23 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000307569  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2383  hydroxyisourate hydrolase  42.37 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.514314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2425  hydroxyisourate hydrolase  42.37 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2071  transthyretin family protein  34.23 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.60516e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2201  transthyretin family protein  34.23 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1675  hydroxyisourate hydrolase  34.23 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018608  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1215  transthyretin family protein  34.23 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000382431  normal  0.571702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2749  transthyretin family protein  34.23 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000377229  normal  0.260044 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0861  hydroxyisourate hydrolase  39.83 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.386947  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1333  hydroxyisourate hydrolase  43.22 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434476 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0235  hydroxyisourate hydrolase  33.33 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1934  putative transthyretin-like protein  41.53 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1916  transthyretin  40 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00116416  normal  0.366234 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2072  transthyretin family protein  42.37 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835202  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0842  transthyretin  42.61 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0207  transthyretin  41.53 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.384919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7200  putative transthyretin-like protein  42.02 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5679  transthyretin  42.61 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1294  hydroxyisourate hydrolase  40.68 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0356  transthyretin  37.29 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470514  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0113  hydroxyisourate hydrolase  42.73 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3476  transthyretin  38.26 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1390  hydroxyisourate hydrolase  39.5 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177512  normal  0.143867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3291  hydroxyisourate hydrolase  41.03 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.379415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  45.69 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6196  hydroxyisourate hydrolase  40.17 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0885  transthyretin  39.83 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0621325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2832  transthyretin  38.66 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0011  hydroxyisourate hydrolase  34.23 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4870  hypothetical protein  35.4 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1043  hydroxyisourate hydrolase  41.23 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1123  transthyretin  41.23 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.424087  normal  0.392641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1143  transthyretin  37.84 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.178877  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1872  hydroxyisourate hydrolase  38.98 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  0.0980153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2121  hydroxyisourate hydrolase  40.35 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2609  transthyretin  40.35 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.846937 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0695  hydroxyisourate hydrolase  40.34 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2434  transthyretin  40.68 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2602  transthyretin  38.26 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166489  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6121  transthyretin  38.98 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1957  transthyretin  38.98 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4619  hydroxyisourate hydrolase  35.4 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437716 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1981  hydroxyisourate hydrolase  38.98 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02519  Transthyretin  36.84 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0815  transthyretin-like protein  32.74 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0576274  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1945  transthyretin  38.14 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0738  transthyretin-like protein  32.74 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.543928  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0063  transthyretin  33.04 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3721  hydroxyisourate hydrolase  38.98 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21140  hydroxyisourate hydrolase, transthyretin family protein  37.93 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0508  hypothetical protein  39.5 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5268  transthyretin  38.14 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1346  hydroxyisourate hydrolase  38.14 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49301  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2070  Transthyretin  38.6 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1102  hydroxyisourate hydrolase  41.18 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3925  hydroxyisourate hydrolase  40.87 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.365607  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2844  transthyretin  38.6 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0511  hydroxyisourate hydrolase  39.5 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2684  putative transthyretin-like protein  42.86 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.427872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0779  putative purine catabolism-related protein  38.46 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3036  transthyretin  38.21 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5814  hydroxyisourate hydrolase  40.52 
 
 		 279 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2064  hydroxyisourate hydrolase  34.48 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057415 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1312  hydroxyisourate hydrolase  38.98 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965379 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0068  transthyretin  37.7 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1745  hydroxyisourate hydrolase  34.19 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1426  transthyretin  39.13 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3340  hydroxyisourate hydrolase  36.13 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>