140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4738 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4738  hydroxyisourate hydrolase  100 
 
 		 109 aa  214  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2772  putative transthyretin-like protein precursor  66.06 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.043163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5277  transthyretin  63.64 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0719  hydroxyisourate hydrolase  62.73 
 
 		 112 aa  117  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2062  hydroxyisourate hydrolase  59.63 
 
 		 98 aa  110  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.268845  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3128  hydroxyisourate hydrolase  54.87 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.041353  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0842  transthyretin  54.78 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0251  hydroxyisourate hydrolase  55.83 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2537  hydroxyisourate hydrolase  55.45 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0113  hydroxyisourate hydrolase  58.56 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5679  transthyretin  53.91 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3733  transthyretin  53.64 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1143  transthyretin  51.85 
 
 		 109 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.178877  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2070  Transthyretin  57.66 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1333  hydroxyisourate hydrolase  50.42 
 
 		 115 aa  100  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1824  hydroxyisourate hydrolase  56.88 
 
 		 108 aa  100  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0913  transthyretin family protein  43.64 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000480656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1681  hydroxyisourate hydrolase  43.64 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000559452  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01885  hypothetical protein  43.64 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01875  hypothetical protein  43.64 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000307569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2749  transthyretin family protein  43.64 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000377229  normal  0.260044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2071  transthyretin family protein  43.64 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.60516e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2201  transthyretin family protein  43.64 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1675  hydroxyisourate hydrolase  43.64 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018608  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1215  transthyretin family protein  43.64 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000382431  normal  0.571702 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1172  hydroxyisourate hydrolase  42.73 
 
 		 136 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1192  hydroxyisourate hydrolase  42.73 
 
 		 136 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1207  hydroxyisourate hydrolase  42.73 
 
 		 136 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1056  hydroxyisourate hydrolase  42.73 
 
 		 136 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1161  hydroxyisourate hydrolase  42.73 
 
 		 136 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3721  hydroxyisourate hydrolase  50.89 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2961  hydroxyisourate hydrolase  53.7 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0011  hydroxyisourate hydrolase  40.18 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0939  transthyretin  45.45 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0063  transthyretin  37.5 
 
 		 136 aa  90.5  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7200  putative transthyretin-like protein  45.22 
 
 		 118 aa  90.5  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0237  hydroxyisourate hydrolase  44.95 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3455  hydroxyisourate hydrolase  47.71 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08260  hydroxyisourate hydrolase  47.71 
 
 		 108 aa  87  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.700555  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3925  hydroxyisourate hydrolase  44.83 
 
 		 116 aa  87  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.365607  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0200  transthyretin  40.35 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1426  transthyretin  45.3 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0101  transthyretin  40.54 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.757339  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3570  hydroxyisourate hydrolase  46.36 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.778424  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1102  hydroxyisourate hydrolase  46.55 
 
 		 118 aa  84.3  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4870  hypothetical protein  41.96 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6773  hydroxyisourate hydrolase  42.34 
 
 		 112 aa  84  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2428  transthyretin  46.85 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1123  transthyretin  45.69 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.424087  normal  0.392641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1043  hydroxyisourate hydrolase  45.69 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0815  transthyretin-like protein  40 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0576274  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0738  transthyretin-like protein  40 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.543928  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0207  transthyretin  43.86 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.384919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  46.15 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1555  transthyretin-like protein  43.86 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552439  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0779  putative purine catabolism-related protein  48.25 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0450  hydroxyisourate hydrolase  43.24 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03210  conserved hypothetical protein  41.44 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2527  putative purine catabolism-related protein  44.35 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0546176  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2383  hydroxyisourate hydrolase  44.35 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.514314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2425  hydroxyisourate hydrolase  44.35 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3036  transthyretin  42.11 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2121  hydroxyisourate hydrolase  43.1 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156864 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1390  hydroxyisourate hydrolase  47.83 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177512  normal  0.143867 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3476  transthyretin  42.11 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4492  hydroxyisourate hydrolase  43.97 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.182838 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1312  hydroxyisourate hydrolase  43.48 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965379 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3340  hydroxyisourate hydrolase  41.38 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2684  putative transthyretin-like protein  45.69 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.427872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2609  transthyretin  41.23 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.846937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3793  hypothetical protein  37.84 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308266  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3148  hydroxyisourate hydrolase  43.22 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300279  normal  0.943913 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0235  hydroxyisourate hydrolase  35.96 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6196  hydroxyisourate hydrolase  44.74 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2072  transthyretin family protein  42.61 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835202  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2844  transthyretin  43.1 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3291  hydroxyisourate hydrolase  46.09 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.379415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1346  hydroxyisourate hydrolase  44.44 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49301  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6121  transthyretin  41.74 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1957  transthyretin  41.74 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2884  hydroxyisourate hydrolase  43.22 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.11874 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1981  hydroxyisourate hydrolase  41.74 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0885  transthyretin  41.23 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0621325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4387  transthyretin  42.24 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5268  transthyretin  40.87 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1916  transthyretin  42.98 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00116416  normal  0.366234 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  44.54 
 
 		 292 aa  74.3  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2602  transthyretin  41.23 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166489  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1945  transthyretin  40.87 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0356  transthyretin  43.59 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470514  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1872  hydroxyisourate hydrolase  40.87 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  0.0980153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4285  transthyretin family protein  40.87 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0861  hydroxyisourate hydrolase  40.87 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.386947  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1583  hydroxyisourate hydrolase  40.87 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3849  hydroxyisourate hydrolase  40.87 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303786  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3611  hydroxyisourate hydrolase  41.74 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1116  transthyretin  44.07 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1933  hydroxyisourate hydrolase  39.47 
 
 		 117 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0633664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2324  hydroxyisourate hydrolase  39.13 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.511264  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02519  Transthyretin  40.35 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>