142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1215 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2749  transthyretin family protein  100 
 
 		 137 aa  285  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000377229  normal  0.260044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2201  transthyretin family protein  100 
 
 		 137 aa  285  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1215  transthyretin family protein  100 
 
 		 137 aa  285  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000382431  normal  0.571702 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01885  hypothetical protein  99.27 
 
 		 137 aa  283  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01875  hypothetical protein  99.27 
 
 		 137 aa  283  5e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000307569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2071  transthyretin family protein  99.27 
 
 		 137 aa  283  5e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.60516e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1675  hydroxyisourate hydrolase  99.27 
 
 		 137 aa  283  5e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018608  normal  0.182378 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1681  hydroxyisourate hydrolase  98.54 
 
 		 137 aa  280  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000559452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0913  transthyretin family protein  97.81 
 
 		 137 aa  280  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000480656  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1056  hydroxyisourate hydrolase  67.65 
 
 		 136 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1172  hydroxyisourate hydrolase  67.65 
 
 		 136 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1192  hydroxyisourate hydrolase  67.65 
 
 		 136 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1207  hydroxyisourate hydrolase  67.65 
 
 		 136 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1161  hydroxyisourate hydrolase  67.65 
 
 		 136 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0063  transthyretin  60.31 
 
 		 136 aa  160  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0011  hydroxyisourate hydrolase  60.91 
 
 		 136 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0101  transthyretin  48.18 
 
 		 135 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.757339  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0200  transthyretin  51.59 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08260  hydroxyisourate hydrolase  51.38 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.700555  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3733  transthyretin  45.87 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2772  putative transthyretin-like protein precursor  44.95 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.043163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5277  transthyretin  49.54 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3455  hydroxyisourate hydrolase  46.79 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4870  hypothetical protein  42.73 
 
 		 113 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3036  transthyretin  42.98 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4738  hydroxyisourate hydrolase  43.64 
 
 		 109 aa  98.2  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1333  hydroxyisourate hydrolase  43.1 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2537  hydroxyisourate hydrolase  43.64 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1824  hydroxyisourate hydrolase  44.04 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3128  hydroxyisourate hydrolase  44.55 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.041353  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0719  hydroxyisourate hydrolase  40.91 
 
 		 112 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0861  hydroxyisourate hydrolase  43.86 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.386947  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0235  hydroxyisourate hydrolase  40.98 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0815  transthyretin-like protein  38.89 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0576274  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0738  transthyretin-like protein  38.89 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.543928  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0939  transthyretin  42.2 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1916  transthyretin  44.54 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00116416  normal  0.366234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5679  transthyretin  44.35 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6773  hydroxyisourate hydrolase  39.09 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1555  transthyretin-like protein  40.35 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552439  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0207  transthyretin  40.35 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.384919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0842  transthyretin  40 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1390  hydroxyisourate hydrolase  42.61 
 
 		 118 aa  87.8  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177512  normal  0.143867 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3476  transthyretin  37.72 
 
 		 118 aa  87  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0113  hydroxyisourate hydrolase  40.37 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2064  hydroxyisourate hydrolase  41.38 
 
 		 130 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7200  putative transthyretin-like protein  39.13 
 
 		 118 aa  86.7  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2428  transthyretin  39.45 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03210  conserved hypothetical protein  39.37 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2609  transthyretin  36.84 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.846937 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2844  transthyretin  40.91 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6196  hydroxyisourate hydrolase  41.23 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2961  hydroxyisourate hydrolase  42.2 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0237  hydroxyisourate hydrolase  37.61 
 
 		 113 aa  84.3  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4619  hydroxyisourate hydrolase  39.82 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437716 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0779  putative purine catabolism-related protein  39.47 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1810  transthyretin  37.72 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2062  hydroxyisourate hydrolase  40.37 
 
 		 98 aa  84  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.268845  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1745  hydroxyisourate hydrolase  40.17 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2832  transthyretin  36.75 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2434  transthyretin  38.6 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3665  hypothetical protein  37.72 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1346  hydroxyisourate hydrolase  40.35 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49301  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3340  hydroxyisourate hydrolase  37.39 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4492  hydroxyisourate hydrolase  37.72 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.182838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4285  transthyretin family protein  37.72 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3148  hydroxyisourate hydrolase  37.39 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300279  normal  0.943913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1583  hydroxyisourate hydrolase  37.72 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3849  hydroxyisourate hydrolase  37.72 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303786  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2884  hydroxyisourate hydrolase  36.52 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.11874 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0356  transthyretin  37.39 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470514  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3721  hydroxyisourate hydrolase  37.17 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2072  transthyretin family protein  38.6 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0885  transthyretin  37.72 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0621325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1116  transthyretin  36.84 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0450  hydroxyisourate hydrolase  36.04 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0068  transthyretin  36.52 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02519  Transthyretin  38.6 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2527  putative purine catabolism-related protein  38.6 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0546176  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2070  Transthyretin  39.13 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1143  transthyretin  38.53 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.178877  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1102  hydroxyisourate hydrolase  36.52 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2116  putative transthyretin-like protein precursor  35.09 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.851558 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1123  transthyretin  37.72 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.424087  normal  0.392641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1043  hydroxyisourate hydrolase  37.72 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3570  hydroxyisourate hydrolase  34.23 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.778424  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1294  hydroxyisourate hydrolase  37.72 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  37.61 
 
 		 292 aa  77.4  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3611  hydroxyisourate hydrolase  36.84 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2757  transthyretin  35.96 
 
 		 117 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.166058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0251  hydroxyisourate hydrolase  37.07 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2383  hydroxyisourate hydrolase  37.72 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.514314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2425  hydroxyisourate hydrolase  37.72 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2121  hydroxyisourate hydrolase  35.09 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1708  transthyretin  35.96 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.187412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2684  putative transthyretin-like protein  35.54 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.427872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0031  transthyretin  36.36 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166572  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1872  hydroxyisourate hydrolase  36.84 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  0.0980153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3793  hypothetical protein  36.7 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308266  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4387  transthyretin  35.09 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>