143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0200 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0200  transthyretin  100 
 
 		 136 aa  278  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0101  transthyretin  58.33 
 
 		 135 aa  158  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.757339  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1056  hydroxyisourate hydrolase  54.46 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1172  hydroxyisourate hydrolase  54.46 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1192  hydroxyisourate hydrolase  54.46 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1207  hydroxyisourate hydrolase  54.46 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1161  hydroxyisourate hydrolase  53.57 
 
 		 136 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0063  transthyretin  50.38 
 
 		 136 aa  130  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01885  hypothetical protein  48.89 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1681  hydroxyisourate hydrolase  47.37 
 
 		 137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000559452  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01875  hypothetical protein  48.89 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000307569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2071  transthyretin family protein  48.89 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.60516e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1675  hydroxyisourate hydrolase  48.89 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018608  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2749  transthyretin family protein  51.59 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000377229  normal  0.260044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2201  transthyretin family protein  51.59 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1215  transthyretin family protein  51.59 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000382431  normal  0.571702 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0913  transthyretin family protein  48.89 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000480656  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0011  hydroxyisourate hydrolase  49.09 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08260  hydroxyisourate hydrolase  44.55 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.700555  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3128  hydroxyisourate hydrolase  44.55 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.041353  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3733  transthyretin  44.55 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0719  hydroxyisourate hydrolase  43.24 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4870  hypothetical protein  39.09 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5679  transthyretin  42.24 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6773  hydroxyisourate hydrolase  40 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3455  hydroxyisourate hydrolase  41.82 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1333  hydroxyisourate hydrolase  41.38 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2772  putative transthyretin-like protein precursor  44.55 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.043163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2609  transthyretin  40.87 
 
 		 118 aa  94.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.846937 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0235  hydroxyisourate hydrolase  41.59 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0068  transthyretin  39.13 
 
 		 118 aa  93.6  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0815  transthyretin-like protein  40 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0576274  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0738  transthyretin-like protein  40 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.543928  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3036  transthyretin  38.6 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0939  transthyretin  39.09 
 
 		 111 aa  92  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3476  transthyretin  40 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1824  hydroxyisourate hydrolase  39.09 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3570  hydroxyisourate hydrolase  38.18 
 
 		 110 aa  91.3  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.778424  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5277  transthyretin  41.82 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0450  hydroxyisourate hydrolase  38.74 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4738  hydroxyisourate hydrolase  40.35 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0842  transthyretin  38.79 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44820  putative transthyretin family protein  36.29 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal  0.119551 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1555  transthyretin-like protein  36.84 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552439  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3915  transthyretin  38.6 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.471177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0207  transthyretin  36.84 
 
 		 117 aa  84.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.384919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21140  hydroxyisourate hydrolase, transthyretin family protein  38.94 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3816  hydroxyisourate hydrolase  36.29 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2324  hydroxyisourate hydrolase  39.47 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.511264  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4492  hydroxyisourate hydrolase  39.47 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.182838 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03210  conserved hypothetical protein  40.91 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3925  hydroxyisourate hydrolase  39.47 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.365607  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0356  transthyretin  37.93 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470514  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0779  putative purine catabolism-related protein  38.6 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2537  hydroxyisourate hydrolase  40.18 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1346  hydroxyisourate hydrolase  37.72 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49301  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2434  transthyretin  36.84 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1116  transthyretin  36.84 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2961  hydroxyisourate hydrolase  39.09 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2062  hydroxyisourate hydrolase  43.64 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.268845  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2844  transthyretin  39.09 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1143  transthyretin  35.45 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.178877  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4619  hydroxyisourate hydrolase  37.17 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437716 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2684  putative transthyretin-like protein  36.84 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.427872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1294  hydroxyisourate hydrolase  37.72 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5268  transthyretin  36.84 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6121  transthyretin  36.84 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1945  transthyretin  36.84 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1957  transthyretin  36.84 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1981  hydroxyisourate hydrolase  36.84 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2064  hydroxyisourate hydrolase  37.07 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1934  putative transthyretin-like protein  36.84 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1916  transthyretin  37.5 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00116416  normal  0.366234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3340  hydroxyisourate hydrolase  37.39 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2121  hydroxyisourate hydrolase  35.96 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156864 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6196  hydroxyisourate hydrolase  38.6 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4285  transthyretin family protein  33.33 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1583  hydroxyisourate hydrolase  33.33 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3205  hydroxyisourate hydrolase  37.61 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.429089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2070  Transthyretin  40.71 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1312  hydroxyisourate hydrolase  35.71 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965379 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1872  hydroxyisourate hydrolase  35.96 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  0.0980153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3148  hydroxyisourate hydrolase  36.52 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300279  normal  0.943913 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02519  Transthyretin  38.05 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1123  transthyretin  35.09 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.424087  normal  0.392641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1043  hydroxyisourate hydrolase  35.09 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3849  hydroxyisourate hydrolase  33.33 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303786  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0885  transthyretin  35.09 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0621325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0861  hydroxyisourate hydrolase  34.21 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.386947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1708  transthyretin  34.21 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.187412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49522  predicted protein  39.83 
 
 		 299 aa  77.4  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.219975  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1745  hydroxyisourate hydrolase  35.9 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0113  hydroxyisourate hydrolase  37.27 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7200  putative transthyretin-like protein  33.91 
 
 		 118 aa  76.6  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1102  hydroxyisourate hydrolase  35.65 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1810  transthyretin  32.46 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2832  transthyretin  35.96 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2884  hydroxyisourate hydrolase  36.52 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.11874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3611  hydroxyisourate hydrolase  33.33 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1933  hydroxyisourate hydrolase  35.09 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0633664 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>