139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0842 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0842  transthyretin  100 
 
 		 136 aa  266  7e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5679  transthyretin  74.07 
 
 		 108 aa  161  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4738  hydroxyisourate hydrolase  54.78 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2062  hydroxyisourate hydrolase  51.85 
 
 		 98 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.268845  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2772  putative transthyretin-like protein precursor  55.26 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.043163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1824  hydroxyisourate hydrolase  49.12 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0719  hydroxyisourate hydrolase  53.51 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0251  hydroxyisourate hydrolase  49.17 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1333  hydroxyisourate hydrolase  47.11 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3128  hydroxyisourate hydrolase  49.15 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.041353  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0113  hydroxyisourate hydrolase  49.57 
 
 		 105 aa  94  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5277  transthyretin  46.96 
 
 		 105 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3733  transthyretin  47.01 
 
 		 113 aa  90.5  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1555  transthyretin-like protein  47.5 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552439  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0207  transthyretin  46.67 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.384919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1172  hydroxyisourate hydrolase  40.87 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1192  hydroxyisourate hydrolase  40.87 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1207  hydroxyisourate hydrolase  40.87 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1161  hydroxyisourate hydrolase  40.87 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1056  hydroxyisourate hydrolase  40.87 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1681  hydroxyisourate hydrolase  40 
 
 		 137 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000559452  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01885  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01875  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000307569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2749  transthyretin family protein  40 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000377229  normal  0.260044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2071  transthyretin family protein  40 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.60516e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2201  transthyretin family protein  40 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1675  hydroxyisourate hydrolase  40 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018608  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1215  transthyretin family protein  40 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000382431  normal  0.571702 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0913  transthyretin family protein  39.13 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000480656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0200  transthyretin  38.79 
 
 		 136 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0101  transthyretin  38.79 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.757339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3455  hydroxyisourate hydrolase  46.15 
 
 		 112 aa  84  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0939  transthyretin  40.87 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  48.74 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08260  hydroxyisourate hydrolase  43.86 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.700555  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3036  transthyretin  42.5 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1390  hydroxyisourate hydrolase  48.76 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177512  normal  0.143867 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0235  hydroxyisourate hydrolase  30.51 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3721  hydroxyisourate hydrolase  42.24 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2537  hydroxyisourate hydrolase  43.97 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6773  hydroxyisourate hydrolase  39.66 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0237  hydroxyisourate hydrolase  40.17 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2602  transthyretin  41.67 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166489  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0815  transthyretin-like protein  35.25 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0576274  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0738  transthyretin-like protein  35.25 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.543928  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2961  hydroxyisourate hydrolase  43.36 
 
 		 106 aa  76.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4870  hypothetical protein  40.17 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1143  transthyretin  40.87 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.178877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3570  hydroxyisourate hydrolase  42.61 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.778424  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  41.22 
 
 		 292 aa  74.7  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0356  transthyretin  41.32 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470514  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0068  transthyretin  42.15 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2609  transthyretin  42.5 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.846937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1934  putative transthyretin-like protein  40.98 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2844  transthyretin  41.59 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3340  hydroxyisourate hydrolase  41.13 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02519  Transthyretin  39.67 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2428  transthyretin  44.35 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2684  putative transthyretin-like protein  42.37 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.427872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0779  putative purine catabolism-related protein  42.98 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0063  transthyretin  32.48 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3148  hydroxyisourate hydrolase  41.13 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300279  normal  0.943913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2070  Transthyretin  46.28 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0450  hydroxyisourate hydrolase  38.1 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1426  transthyretin  42.28 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4619  hydroxyisourate hydrolase  42.5 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437716 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1312  hydroxyisourate hydrolase  39.44 
 
 		 206 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2064  hydroxyisourate hydrolase  42.28 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057415 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0011  hydroxyisourate hydrolase  33.33 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03210  conserved hypothetical protein  34.96 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2072  transthyretin family protein  40.98 
 
 		 194 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835202  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1745  hydroxyisourate hydrolase  41.94 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6196  hydroxyisourate hydrolase  43.33 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2324  hydroxyisourate hydrolase  40.16 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.511264  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1916  transthyretin  36.8 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00116416  normal  0.366234 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3476  transthyretin  39.17 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1102  hydroxyisourate hydrolase  40.5 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4492  hydroxyisourate hydrolase  40.32 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.182838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3816  hydroxyisourate hydrolase  38.02 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44820  putative transthyretin family protein  38.02 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal  0.119551 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2527  putative purine catabolism-related protein  39.53 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0546176  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2383  hydroxyisourate hydrolase  39.53 
 
 		 117 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.514314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2425  hydroxyisourate hydrolase  39.53 
 
 		 117 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1872  hydroxyisourate hydrolase  40.16 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  0.0980153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1945  transthyretin  40.16 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0861  hydroxyisourate hydrolase  36.89 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.386947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4387  transthyretin  38.52 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2884  hydroxyisourate hydrolase  39.52 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.11874 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5268  transthyretin  39.34 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6121  transthyretin  39.34 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2832  transthyretin  38.84 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1957  transthyretin  39.34 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1981  hydroxyisourate hydrolase  39.34 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  40.83 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3925  hydroxyisourate hydrolase  37.5 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.365607  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1346  hydroxyisourate hydrolase  39.67 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49301  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2121  hydroxyisourate hydrolase  37.5 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0885  transthyretin  37.4 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0621325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3793  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308266  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3915  transthyretin  39.17 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.471177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>