140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0011 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0011  hydroxyisourate hydrolase  100 
 
 		 136 aa  279  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0063  transthyretin  77.21 
 
 		 136 aa  222  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1681  hydroxyisourate hydrolase  56.49 
 
 		 137 aa  147  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000559452  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01885  hypothetical protein  56.49 
 
 		 137 aa  147  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01875  hypothetical protein  56.49 
 
 		 137 aa  147  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000307569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2071  transthyretin family protein  56.49 
 
 		 137 aa  147  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.60516e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1675  hydroxyisourate hydrolase  56.49 
 
 		 137 aa  147  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018608  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2749  transthyretin family protein  53.62 
 
 		 137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000377229  normal  0.260044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2201  transthyretin family protein  53.62 
 
 		 137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1215  transthyretin family protein  53.62 
 
 		 137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000382431  normal  0.571702 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0913  transthyretin family protein  55.3 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000480656  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1192  hydroxyisourate hydrolase  61.82 
 
 		 136 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1207  hydroxyisourate hydrolase  61.82 
 
 		 136 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1056  hydroxyisourate hydrolase  61.82 
 
 		 136 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1172  hydroxyisourate hydrolase  61.82 
 
 		 136 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1161  hydroxyisourate hydrolase  60.91 
 
 		 136 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0200  transthyretin  45.86 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0101  transthyretin  46.32 
 
 		 135 aa  124  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.757339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6773  hydroxyisourate hydrolase  43.64 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3733  transthyretin  43.64 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1333  hydroxyisourate hydrolase  43.59 
 
 		 115 aa  99.4  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434476 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4870  hypothetical protein  39.09 
 
 		 113 aa  96.7  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5277  transthyretin  45.05 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08260  hydroxyisourate hydrolase  44.55 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.700555  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3455  hydroxyisourate hydrolase  42.73 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3128  hydroxyisourate hydrolase  38.74 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.041353  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4738  hydroxyisourate hydrolase  40.18 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2772  putative transthyretin-like protein precursor  41.44 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.043163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0815  transthyretin-like protein  36.15 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0576274  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0738  transthyretin-like protein  36.15 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.543928  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1824  hydroxyisourate hydrolase  40 
 
 		 108 aa  87  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0719  hydroxyisourate hydrolase  36.94 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0235  hydroxyisourate hydrolase  41.96 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44820  putative transthyretin family protein  32.2 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal  0.119551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3816  hydroxyisourate hydrolase  32.2 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0207  transthyretin  34.48 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.384919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3036  transthyretin  36.21 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5679  transthyretin  35.9 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1810  transthyretin  33.62 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2064  hydroxyisourate hydrolase  35.34 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3665  hypothetical protein  33.61 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1555  transthyretin-like protein  33.62 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552439  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6196  hydroxyisourate hydrolase  36.21 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2434  transthyretin  32.76 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2070  Transthyretin  39.47 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2116  putative transthyretin-like protein precursor  32.76 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.851558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1933  hydroxyisourate hydrolase  36.21 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0633664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0237  hydroxyisourate hydrolase  35.45 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1745  hydroxyisourate hydrolase  35.04 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1708  transthyretin  32.76 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.187412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2609  transthyretin  36.44 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.846937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0885  transthyretin  32.76 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0621325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4619  hydroxyisourate hydrolase  31.9 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2256  hydroxyisourate hydrolase  36.21 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0113  hydroxyisourate hydrolase  35.14 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2757  transthyretin  33.62 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.166058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1346  hydroxyisourate hydrolase  33.62 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4285  transthyretin family protein  31.03 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1143  transthyretin  36.94 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.178877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1583  hydroxyisourate hydrolase  31.03 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1916  transthyretin  36.07 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00116416  normal  0.366234 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0779  putative purine catabolism-related protein  33.62 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4492  hydroxyisourate hydrolase  33.05 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.182838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3849  hydroxyisourate hydrolase  31.03 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303786  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2121  hydroxyisourate hydrolase  32.46 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156864 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03210  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 		 117 aa  72  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2602  transthyretin  35.25 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166489  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2844  transthyretin  35.4 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0450  hydroxyisourate hydrolase  31.58 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0939  transthyretin  33.33 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2537  hydroxyisourate hydrolase  34.82 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7200  putative transthyretin-like protein  35.9 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2832  transthyretin  32.76 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3570  hydroxyisourate hydrolase  34.23 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.778424  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3476  transthyretin  33.33 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3611  hydroxyisourate hydrolase  30.17 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0842  transthyretin  33.33 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2062  hydroxyisourate hydrolase  36.94 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.268845  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3793  hypothetical protein  32.73 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308266  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3721  hydroxyisourate hydrolase  33.62 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2961  hydroxyisourate hydrolase  39.09 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02519  Transthyretin  35.71 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3925  hydroxyisourate hydrolase  31.58 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.365607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4040  transthyretin  28.32 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.369839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1116  transthyretin  28.95 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21140  hydroxyisourate hydrolase, transthyretin family protein  30.09 
 
 		 116 aa  67  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1390  hydroxyisourate hydrolase  31.3 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177512  normal  0.143867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0251  hydroxyisourate hydrolase  34.19 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1123  transthyretin  30.7 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.424087  normal  0.392641 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0511  hydroxyisourate hydrolase  33.05 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1043  hydroxyisourate hydrolase  30.7 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  35.29 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_004310  BR0508  hypothetical protein  33.05 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0068  transthyretin  30.25 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0695  hydroxyisourate hydrolase  31.62 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1294  hydroxyisourate hydrolase  31.9 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0861  hydroxyisourate hydrolase  31.58 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.386947  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1934  putative transthyretin-like protein  31.9 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1426  transthyretin  35.04 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2428  transthyretin  32.74 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>