133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3793 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3793  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  229  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308266  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0719  hydroxyisourate hydrolase  37.61 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3128  hydroxyisourate hydrolase  40.18 
 
 		 112 aa  83.6  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.041353  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2772  putative transthyretin-like protein precursor  40 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.043163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1333  hydroxyisourate hydrolase  37.29 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5277  transthyretin  38.18 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4738  hydroxyisourate hydrolase  37.84 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5679  transthyretin  37.07 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1192  hydroxyisourate hydrolase  35.78 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1207  hydroxyisourate hydrolase  35.78 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1056  hydroxyisourate hydrolase  35.78 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1172  hydroxyisourate hydrolase  35.78 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1161  hydroxyisourate hydrolase  35.78 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3733  transthyretin  34.26 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1681  hydroxyisourate hydrolase  36.7 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000559452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0200  transthyretin  34.55 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0913  transthyretin family protein  36.7 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000480656  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01885  hypothetical protein  36.7 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2071  transthyretin family protein  36.7 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.60516e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2201  transthyretin family protein  36.7 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1675  hydroxyisourate hydrolase  36.7 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018608  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1215  transthyretin family protein  36.7 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000382431  normal  0.571702 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01875  hypothetical protein  36.7 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000307569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2749  transthyretin family protein  36.7 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000377229  normal  0.260044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2062  hydroxyisourate hydrolase  38.18 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.268845  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1824  hydroxyisourate hydrolase  33.94 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3455  hydroxyisourate hydrolase  31.48 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0237  hydroxyisourate hydrolase  36.11 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0101  transthyretin  32.73 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.757339  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0063  transthyretin  31.82 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0939  transthyretin  35.78 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0011  hydroxyisourate hydrolase  32.73 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08260  hydroxyisourate hydrolase  35.19 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.700555  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1555  transthyretin-like protein  36.84 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552439  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0207  transthyretin  36.84 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.384919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4246  Transthyretin  32.71 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6773  hydroxyisourate hydrolase  30 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0842  transthyretin  32.76 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2844  transthyretin  32.73 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0113  hydroxyisourate hydrolase  32.73 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0251  hydroxyisourate hydrolase  30.58 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6196  hydroxyisourate hydrolase  35.09 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44820  putative transthyretin family protein  30.7 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal  0.119551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2537  hydroxyisourate hydrolase  33.04 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3816  hydroxyisourate hydrolase  30.7 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0235  hydroxyisourate hydrolase  33.04 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3570  hydroxyisourate hydrolase  34.26 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.778424  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2961  hydroxyisourate hydrolase  34.26 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4492  hydroxyisourate hydrolase  31.58 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.182838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1708  transthyretin  29.91 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.187412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3148  hydroxyisourate hydrolase  29.31 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300279  normal  0.943913 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3340  hydroxyisourate hydrolase  30.17 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0450  hydroxyisourate hydrolase  30.63 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02519  Transthyretin  27.93 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1346  hydroxyisourate hydrolase  33.33 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49301  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2884  hydroxyisourate hydrolase  28.45 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.11874 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03210  conserved hypothetical protein  35.45 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1426  transthyretin  29.91 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1390  hydroxyisourate hydrolase  31.3 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177512  normal  0.143867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1945  transthyretin  29.82 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7200  putative transthyretin-like protein  33.91 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2684  putative transthyretin-like protein  28.95 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.427872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5268  transthyretin  29.82 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2428  transthyretin  30.56 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2832  transthyretin  30.7 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1872  hydroxyisourate hydrolase  29.82 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  0.0980153 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1810  transthyretin  28.95 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6121  transthyretin  29.82 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1957  transthyretin  29.82 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2383  hydroxyisourate hydrolase  28.95 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.514314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2425  hydroxyisourate hydrolase  28.95 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1981  hydroxyisourate hydrolase  29.82 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3925  hydroxyisourate hydrolase  29.31 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.365607  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3721  hydroxyisourate hydrolase  32.74 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5848  hydroxyisourate hydrolase  27.19 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0613871  hitchhiker  0.00026614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3665  hypothetical protein  28.07 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3611  hydroxyisourate hydrolase  25.44 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2064  hydroxyisourate hydrolase  31.93 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057415 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2527  putative purine catabolism-related protein  28.07 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0546176  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0861  hydroxyisourate hydrolase  29.82 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.386947  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3036  transthyretin  33.62 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1312  hydroxyisourate hydrolase  30.77 
 
 		 206 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965379 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0815  transthyretin-like protein  27.43 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0576274  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2602  transthyretin  27.19 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166489  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0738  transthyretin-like protein  27.43 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.543928  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3849  hydroxyisourate hydrolase  28.07 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303786  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4285  transthyretin family protein  28.07 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0508  hypothetical protein  31.3 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1583  hydroxyisourate hydrolase  28.07 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1745  hydroxyisourate hydrolase  31.09 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2324  hydroxyisourate hydrolase  28.07 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.511264  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2072  transthyretin family protein  29.06 
 
 		 194 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835202  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0032  transthyretin  27.83 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186384  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1934  putative transthyretin-like protein  28.07 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1102  hydroxyisourate hydrolase  28.7 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1916  transthyretin  28.57 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00116416  normal  0.366234 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4387  transthyretin  28.45 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1783  hydroxyisourate hydrolase  30.17 
 
 		 115 aa  50.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.176528 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0511  hydroxyisourate hydrolase  30.43 
 
 		 118 aa  50.1  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2121  hydroxyisourate hydrolase  29.31 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156864 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>