141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6773 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6773  hydroxyisourate hydrolase  100 
 
 		 112 aa  233  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4870  hypothetical protein  53.98 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3733  transthyretin  51.33 
 
 		 113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0815  transthyretin-like protein  46.49 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0576274  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0738  transthyretin-like protein  46.49 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.543928  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1172  hydroxyisourate hydrolase  46.36 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1056  hydroxyisourate hydrolase  46.36 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1192  hydroxyisourate hydrolase  46.36 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1207  hydroxyisourate hydrolase  46.36 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1161  hydroxyisourate hydrolase  46.36 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0011  hydroxyisourate hydrolase  43.64 
 
 		 136 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0235  hydroxyisourate hydrolase  44.64 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0101  transthyretin  42.73 
 
 		 135 aa  105  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.757339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3455  hydroxyisourate hydrolase  49.11 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0719  hydroxyisourate hydrolase  48.25 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0063  transthyretin  42.73 
 
 		 136 aa  103  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2961  hydroxyisourate hydrolase  51.79 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3128  hydroxyisourate hydrolase  47.27 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.041353  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2772  putative transthyretin-like protein precursor  47.27 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.043163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0200  transthyretin  40 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3721  hydroxyisourate hydrolase  48.72 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5277  transthyretin  48.18 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1824  hydroxyisourate hydrolase  48.67 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21140  hydroxyisourate hydrolase, transthyretin family protein  42.24 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1333  hydroxyisourate hydrolase  43.1 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434476 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4619  hydroxyisourate hydrolase  42.11 
 
 		 123 aa  93.6  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437716 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0939  transthyretin  45.13 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1555  transthyretin-like protein  42.74 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552439  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1933  hydroxyisourate hydrolase  44.44 
 
 		 117 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0633664 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0207  transthyretin  41.88 
 
 		 117 aa  90.9  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.384919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3205  hydroxyisourate hydrolase  45.61 
 
 		 117 aa  90.1  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.429089 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2749  transthyretin family protein  39.09 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000377229  normal  0.260044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01885  hypothetical protein  39.09 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1681  hydroxyisourate hydrolase  39.09 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000559452  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01875  hypothetical protein  39.09 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000307569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2071  transthyretin family protein  39.09 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.60516e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2201  transthyretin family protein  39.09 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1675  hydroxyisourate hydrolase  39.09 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018608  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1215  transthyretin family protein  39.09 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000382431  normal  0.571702 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0913  transthyretin family protein  39.09 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000480656  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1916  transthyretin  43.8 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00116416  normal  0.366234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2064  hydroxyisourate hydrolase  44.92 
 
 		 130 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057415 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2256  hydroxyisourate hydrolase  41.88 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5679  transthyretin  43.1 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1745  hydroxyisourate hydrolase  44.54 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08260  hydroxyisourate hydrolase  46.02 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.700555  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2434  transthyretin  43.59 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1872  hydroxyisourate hydrolase  44.44 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  0.0980153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0251  hydroxyisourate hydrolase  45 
 
 		 118 aa  87.4  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3925  hydroxyisourate hydrolase  42.98 
 
 		 116 aa  87  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.365607  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2116  putative transthyretin-like protein precursor  40.17 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.851558 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5268  transthyretin  44.44 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1945  transthyretin  44.44 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1708  transthyretin  38.46 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.187412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0885  transthyretin  42.74 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0621325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6121  transthyretin  44.44 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1957  transthyretin  44.44 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3036  transthyretin  42.74 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2121  hydroxyisourate hydrolase  42.11 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3849  hydroxyisourate hydrolase  38.46 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303786  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3611  hydroxyisourate hydrolase  37.61 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1981  hydroxyisourate hydrolase  44.44 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4285  transthyretin family protein  37.61 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1583  hydroxyisourate hydrolase  37.61 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4738  hydroxyisourate hydrolase  42.34 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1123  transthyretin  42.11 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.424087  normal  0.392641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1043  hydroxyisourate hydrolase  42.11 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03210  conserved hypothetical protein  43.12 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02519  Transthyretin  39.47 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1346  hydroxyisourate hydrolase  43.59 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49301  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6196  hydroxyisourate hydrolase  46.22 
 
 		 117 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0356  transthyretin  43.22 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470514  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1810  transthyretin  39.83 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0068  transthyretin  40.68 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3915  transthyretin  40.71 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.471177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0779  putative purine catabolism-related protein  41.88 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3340  hydroxyisourate hydrolase  42.62 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2527  putative purine catabolism-related protein  41.03 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0546176  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1426  transthyretin  43.48 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1116  transthyretin  42.11 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0450  hydroxyisourate hydrolase  42.11 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1312  hydroxyisourate hydrolase  42.74 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965379 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0113  hydroxyisourate hydrolase  41.82 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3570  hydroxyisourate hydrolase  37.5 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.778424  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2832  transthyretin  38.6 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2757  transthyretin  38.46 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.166058 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4492  hydroxyisourate hydrolase  39.13 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.182838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2324  hydroxyisourate hydrolase  41.88 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.511264  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2383  hydroxyisourate hydrolase  41.03 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.514314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2425  hydroxyisourate hydrolase  41.03 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3148  hydroxyisourate hydrolase  42.02 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300279  normal  0.943913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2062  hydroxyisourate hydrolase  43.64 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.268845  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1390  hydroxyisourate hydrolase  38.14 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177512  normal  0.143867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44820  putative transthyretin family protein  37.61 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal  0.119551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3665  hypothetical protein  36.75 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4387  transthyretin  40.35 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3816  hydroxyisourate hydrolase  36.75 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2602  transthyretin  39.13 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0237  hydroxyisourate hydrolase  38.74 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1783  hydroxyisourate hydrolase  43.7 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.176528 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>