102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4246 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4246  Transthyretin  100 
 
 		 132 aa  267  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3733  transthyretin  33.03 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3793  hypothetical protein  32.71 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308266  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1333  hydroxyisourate hydrolase  35.59 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0913  transthyretin family protein  28.44 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000480656  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0101  transthyretin  30 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.757339  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3128  hydroxyisourate hydrolase  33.04 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.041353  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6196  hydroxyisourate hydrolase  38.26 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01885  hypothetical protein  27.52 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1681  hydroxyisourate hydrolase  27.52 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000559452  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2071  transthyretin family protein  27.52 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.60516e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2201  transthyretin family protein  27.52 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1675  hydroxyisourate hydrolase  27.52 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018608  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1215  transthyretin family protein  27.52 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000382431  normal  0.571702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2749  transthyretin family protein  27.52 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000377229  normal  0.260044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01875  hypothetical protein  27.52 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000307569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2961  hydroxyisourate hydrolase  34.26 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2537  hydroxyisourate hydrolase  32.73 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0200  transthyretin  30.91 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0011  hydroxyisourate hydrolase  27.27 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0251  hydroxyisourate hydrolase  30.51 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1192  hydroxyisourate hydrolase  27.52 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1207  hydroxyisourate hydrolase  27.52 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1056  hydroxyisourate hydrolase  27.52 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1172  hydroxyisourate hydrolase  27.52 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4738  hydroxyisourate hydrolase  30.91 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2772  putative transthyretin-like protein precursor  33.94 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.043163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0063  transthyretin  24.55 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1161  hydroxyisourate hydrolase  27.52 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0939  transthyretin  30.28 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2072  transthyretin family protein  33.04 
 
 		 194 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835202  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0719  hydroxyisourate hydrolase  28.44 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2062  hydroxyisourate hydrolase  32.11 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.268845  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5277  transthyretin  28.44 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2527  putative purine catabolism-related protein  32.17 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0546176  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2383  hydroxyisourate hydrolase  32.17 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.514314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2425  hydroxyisourate hydrolase  32.17 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3455  hydroxyisourate hydrolase  29.63 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2844  transthyretin  32.73 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08260  hydroxyisourate hydrolase  27.78 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.700555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1810  transthyretin  28.7 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5268  transthyretin  30.43 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6121  transthyretin  30.43 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1945  transthyretin  30.43 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1957  transthyretin  30.43 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7200  putative transthyretin-like protein  33.33 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1981  hydroxyisourate hydrolase  30.43 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1872  hydroxyisourate hydrolase  30.43 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  0.0980153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1294  hydroxyisourate hydrolase  30.43 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2324  hydroxyisourate hydrolase  32.76 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.511264  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4285  transthyretin family protein  29.31 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1934  putative transthyretin-like protein  32.76 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1583  hydroxyisourate hydrolase  29.31 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3816  hydroxyisourate hydrolase  30.17 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1390  hydroxyisourate hydrolase  32.48 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177512  normal  0.143867 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3665  hypothetical protein  29.57 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44820  putative transthyretin family protein  30.17 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal  0.119551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3611  hydroxyisourate hydrolase  27.83 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0237  hydroxyisourate hydrolase  26.36 
 
 		 113 aa  47.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3849  hydroxyisourate hydrolase  29.31 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303786  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4387  transthyretin  29.31 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2884  hydroxyisourate hydrolase  30.43 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.11874 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2116  putative transthyretin-like protein precursor  32.17 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.851558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1312  hydroxyisourate hydrolase  31.3 
 
 		 206 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965379 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0113  hydroxyisourate hydrolase  26.61 
 
 		 105 aa  47.4  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2064  hydroxyisourate hydrolase  29.91 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057415 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3570  hydroxyisourate hydrolase  29.36 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.778424  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6773  hydroxyisourate hydrolase  25.69 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1824  hydroxyisourate hydrolase  28.7 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1143  transthyretin  30.84 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.178877  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3036  transthyretin  28.7 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2757  transthyretin  27.83 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.166058 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0450  hydroxyisourate hydrolase  29.2 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0695  hydroxyisourate hydrolase  31.62 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2832  transthyretin  28.45 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5679  transthyretin  27.83 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0779  putative purine catabolism-related protein  28.7 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0861  hydroxyisourate hydrolase  26.96 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.386947  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4492  hydroxyisourate hydrolase  28.45 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.182838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3721  hydroxyisourate hydrolase  29.46 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3148  hydroxyisourate hydrolase  29.57 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300279  normal  0.943913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1708  transthyretin  26.09 
 
 		 117 aa  43.9  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.187412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1916  transthyretin  25 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00116416  normal  0.366234 
 
 
-
 
NC_004310  BR0508  hypothetical protein  30.77 
 
 		 118 aa  43.5  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0511  hydroxyisourate hydrolase  30.77 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1933  hydroxyisourate hydrolase  28.7 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0633664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1555  transthyretin-like protein  32.17 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552439  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2602  transthyretin  28.32 
 
 		 124 aa  42.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166489  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0356  transthyretin  27.83 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470514  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0207  transthyretin  32.17 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.384919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2070  Transthyretin  30.63 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2256  hydroxyisourate hydrolase  28.7 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3476  transthyretin  26.32 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1745  hydroxyisourate hydrolase  28.81 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1426  transthyretin  27.35 
 
 		 117 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1346  hydroxyisourate hydrolase  26.96 
 
 		 116 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0885  transthyretin  27.83 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0621325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3340  hydroxyisourate hydrolase  26.96 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2709  hydroxyisourate hydrolase  24.79 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0815  transthyretin-like protein  24.56 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0576274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>