More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0345 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0345  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  770    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03470  hypothetical protein  91.48 
 
 		 399 aa  704    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.20054e-16 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0189  signal transduction protein  52.55 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0239  putative signal transduction protein  51.72 
 
 		 412 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0230  putative signal transduction protein  51.41 
 
 		 419 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0215  putative signal transduction protein  50.9 
 
 		 419 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661752 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4997  putative signal transduction protein  51.75 
 
 		 420 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.720845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4372  putative signal transduction protein  51.92 
 
 		 404 aa  325  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0089  response regulator receiver  47.59 
 
 		 462 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62061  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0303  response regulator  48.11 
 
 		 462 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4310  response regulator receiver protein  35.01 
 
 		 373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3669  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 373 aa  129  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  32.92 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  25.2 
 
 		 271 aa  67  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.37 
 
 		 231 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0574949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  28.73 
 
 		 283 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.5 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  32.2 
 
 		 619 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 1383 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1701  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.6 
 
 		 236 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  32.26 
 
 		 1970 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  31.79 
 
 		 287 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  32.41 
 
 		 131 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 941 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  32.41 
 
 		 131 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  36.97 
 
 		 1299 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  34.94 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  27.91 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  33.65 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.62 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 2009 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.62 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2712  response regulator receiver protein  34.83 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 2012 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  27.69 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 911 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 934 aa  60.1  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0607  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 911 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  31.48 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  34.94 
 
 		 129 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.71 
 
 		 227 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 127 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2854  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.938378  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  32.41 
 
 		 131 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  28.23 
 
 		 139 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 1361 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1718  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  33.65 
 
 		 114 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123657  normal  0.330676 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 911 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  27.5 
 
 		 2048 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.27 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.34 
 
 		 1152 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_166  DNA-binding response regulator  28.79 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2262  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  32.53 
 
 		 126 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2593  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.67 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.483  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 1118 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  31.48 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  32.58 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.6 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  24.24 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0183  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.8 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  31.46 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5610  response regulator receiver domain-containing protein  28.33 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  31.46 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 1287 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  31.46 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  36.67 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1415 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  26.92 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  32.5 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 1385 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  25.48 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 126 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  29.45 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  31.46 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1826  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  34.71 
 
 		 1427 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 1370 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  29.81 
 
 		 126 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 2175 aa  57  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0203  response regulator receiver  32.2 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.07 
 
 		 230 aa  57  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  30.89 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  24.49 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  31.46 
 
 		 129 aa  57  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  33.73 
 
 		 130 aa  57  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0450  response regulator receiver protein  27.95 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.46 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1977  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  29.6 
 
 		 1374 aa  56.6  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 1426 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  30.68 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  31.46 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  31.46 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>