More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3669 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3669  response regulator receiver protein  100 
 
 		 373 aa  748    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4310  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0189  signal transduction protein  30.3 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0239  putative signal transduction protein  30 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4372  putative signal transduction protein  33.91 
 
 		 404 aa  132  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4997  putative signal transduction protein  29.72 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.720845  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0215  putative signal transduction protein  29.17 
 
 		 419 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03470  hypothetical protein  30.39 
 
 		 399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.20054e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0230  putative signal transduction protein  28.61 
 
 		 419 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0303  response regulator  28.53 
 
 		 462 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0089  response regulator receiver  28.81 
 
 		 462 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0345  hypothetical protein  30.52 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1693  two-component regulator  29.61 
 
 		 223 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000232098  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 126 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  37.65 
 
 		 128 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0242  two-component regulator  29.13 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20879  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 128 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 128 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0133  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.68 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  38.67 
 
 		 128 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3751  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  34.29 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 126 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5610  response regulator receiver domain-containing protein  29.75 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0675  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 579 aa  73.2  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.775979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  38.67 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0753  sigma-54 dependent response regulator  31.86 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0980  response regulator receiver domain-containing protein  28.16 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000790444  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4001  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  30.95 
 
 		 229 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1479  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.09 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  40 
 
 		 126 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  36.84 
 
 		 128 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 139 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 		 125 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0404  DNA-binding response regulator  27.18 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.887957  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  35.14 
 
 		 124 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0235  response regulator receiver  27.67 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1603  DNA-binding response regulator  27.18 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0745  two-component regulator  33.91 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.802142  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0664  two component transcriptional regulator  27.8 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  30.58 
 
 		 124 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2124  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.5 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0345179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 127 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 123 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2156  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  38.67 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  31.82 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  38.67 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22760  putative two-component response regulator  31.76 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  31.97 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2399  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.58 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00272  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1128  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  30.51 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.40399  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1894  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000765732  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  36.49 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  36.49 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  29.17 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  36.49 
 
 		 129 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  37.84 
 
 		 129 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  37.84 
 
 		 129 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  37.84 
 
 		 129 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  37.84 
 
 		 129 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  31.93 
 
 		 236 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 127 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0379  DNA-binding response regulator  26.7 
 
 		 223 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  38.16 
 
 		 139 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3345  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2115  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 127 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  31.97 
 
 		 127 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2035  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.806395  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6964  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.51 
 
 		 226 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.043471  normal  0.107802 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  36.49 
 
 		 129 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  34.21 
 
 		 130 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59780  putative kinase sensor protein  31.62 
 
 		 1084 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000030188  hitchhiker  3.75506e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  37.84 
 
 		 129 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  36.49 
 
 		 129 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 236 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1358  two component transcriptional regulator  33.59 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  36.36 
 
 		 126 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  35.14 
 
 		 131 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  36.49 
 
 		 129 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  35.14 
 
 		 129 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 129 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 127 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.9 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  36.36 
 
 		 130 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 127 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1827  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00738443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2150  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00200664  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09498  two-component system, transcriptional regulatory protein  29.35 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 126 aa  68.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  36.49 
 
 		 127 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>