More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_03470 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0345  hypothetical protein  91.48 
 
 		 399 aa  684    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03470  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  771    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.20054e-16 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0189  signal transduction protein  53.65 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0239  putative signal transduction protein  51.88 
 
 		 412 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0230  putative signal transduction protein  52.19 
 
 		 419 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0215  putative signal transduction protein  51.67 
 
 		 419 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661752 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4997  putative signal transduction protein  51.38 
 
 		 420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.720845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4372  putative signal transduction protein  51.66 
 
 		 404 aa  325  9e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0089  response regulator receiver  47.59 
 
 		 462 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62061  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0303  response regulator  46.46 
 
 		 462 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4310  response regulator receiver protein  32.6 
 
 		 373 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3669  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  32.3 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  25.4 
 
 		 271 aa  69.3  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  28.49 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.38 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 126 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  34.94 
 
 		 130 aa  63.9  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.67 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.67 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.92 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0574949  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 1287 aa  63.5  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 2009 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0911  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.546486 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0948  response regulator receiver  34.65 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.910201  normal  0.0640944 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 934 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 2012 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 1299 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 1118 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.49 
 
 		 229 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0607  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 248 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  32.41 
 
 		 131 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 2137 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  31.48 
 
 		 131 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 2026 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2593  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.56 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.483  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  30.3 
 
 		 2026 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 127 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  31.48 
 
 		 129 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0999  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.2 
 
 		 872 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  31.48 
 
 		 131 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  29.84 
 
 		 1970 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5610  response regulator receiver domain-containing protein  28.33 
 
 		 318 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 1383 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 		 1426 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  27.69 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  30.68 
 
 		 119 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0887  response regulator receiver protein  33.66 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 2022 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  31.36 
 
 		 619 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0687  DNA-binding response regulator  28.8 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  28.1 
 
 		 1374 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0719  DNA-binding response regulator  27.78 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  31.33 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1426  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.89 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4651  DNA-binding response regulator  28.8 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00217543  unclonable  3.82242e-26 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.48 
 
 		 1152 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  31.82 
 
 		 126 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  25 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 1415 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  27.5 
 
 		 2048 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  33.73 
 
 		 126 aa  60.5  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  30.84 
 
 		 127 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  30.56 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  29.66 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2712  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1826  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.06 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  30.84 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0565  two component transcriptional regulator  28 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 941 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1718  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  33.73 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123657  normal  0.330676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0493  signal transduction histidine kinase, LytS  29.03 
 
 		 1022 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000359244  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0618  DNA-binding response regulator  27.78 
 
 		 225 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 911 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0203  response regulator receiver  33.05 
 
 		 231 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  32.47 
 
 		 287 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 2164 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 911 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0651  DNA-binding response regulator  27.78 
 
 		 225 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 179 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  31.73 
 
 		 131 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  32.5 
 
 		 1643 aa  58.9  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3468  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.23 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  33.33 
 
 		 1427 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  26 
 
 		 154 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  30.51 
 
 		 238 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 125 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 2175 aa  58.9  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  29.66 
 
 		 231 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  30.83 
 
 		 236 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  31.46 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>