More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0379 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0379  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1603  DNA-binding response regulator  98.65 
 
 		 223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0404  DNA-binding response regulator  99.1 
 
 		 223 aa  450  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.887957  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0175  two-component response regulator  83.41 
 
 		 224 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1693  two-component regulator  81.61 
 
 		 223 aa  395  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000232098  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0980  response regulator receiver domain-containing protein  82.06 
 
 		 223 aa  394  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000790444  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0235  response regulator receiver  83.33 
 
 		 223 aa  394  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0242  two-component regulator  82.06 
 
 		 223 aa  394  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20879  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0745  two-component regulator  82.06 
 
 		 223 aa  387  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.802142  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0664  two component transcriptional regulator  70.72 
 
 		 237 aa  345  5e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1559  response regulator receiver  34.67 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  34.09 
 
 		 227 aa  141  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  32.89 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1610  two component transcriptional regulator  33.79 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.496365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 228 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  30.36 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  30.8 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.25 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  35.32 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.51 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  31.51 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.51 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.51 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3919  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.63 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  30 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  31.86 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.98 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  33.18 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  33.79 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.42 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1233  two component transcriptional regulator  34.09 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  32.11 
 
 		 224 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  32.11 
 
 		 224 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.36 
 
 		 227 aa  127  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3997  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.63 
 
 		 227 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  33.33 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  33.33 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  33.33 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4527  two component transcriptional regulator  34.09 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3856  two component transcriptional regulator  31.39 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.04 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.88 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.13 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  32.42 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  30.77 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.13 
 
 		 238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  35.32 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.42 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.08 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  31.65 
 
 		 224 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2192  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.09 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.42 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1381  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.64 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961918 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  31.84 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  30 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  32.44 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  30.91 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  32.11 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2084  DNA-binding heavy metal response regulator  34.09 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000771382  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2480  DNA-binding heavy metal response regulator  34.09 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000187636  normal  0.518539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  31.98 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  31.96 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  30.36 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  32.13 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  29.86 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  31.65 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.96 
 
 		 224 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2388  heavy metal response regulator  34.23 
 
 		 228 aa  125  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000142984  normal  0.119734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2101  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 228 aa  125  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  31.65 
 
 		 224 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.7 
 
 		 266 aa  124  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5331  transcriptional regulator two components regulatory system  30.91 
 
 		 225 aa  124  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0274603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0376  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.98 
 
 		 232 aa  124  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.04 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0029  DNA-binding response regulator CzrR  33.94 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 		 219 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.98 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  29.6 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  31.72 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  31.72 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0046  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.94 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  32 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.94 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.955175  hitchhiker  0.00039578 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  31.7 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  31.42 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.94 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  31.53 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>