More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0242 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0242  two-component regulator  100 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20879  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1693  two-component regulator  94.62 
 
 		 223 aa  436  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000232098  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0235  response regulator receiver  94.14 
 
 		 223 aa  431  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0980  response regulator receiver domain-containing protein  93.27 
 
 		 223 aa  431  1e-120  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000790444  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0745  two-component regulator  91.03 
 
 		 223 aa  419  1e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.802142  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1603  DNA-binding response regulator  81.61 
 
 		 223 aa  394  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0379  DNA-binding response regulator  82.06 
 
 		 223 aa  394  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0404  DNA-binding response regulator  81.17 
 
 		 223 aa  389  1e-107  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.887957  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0175  two-component response regulator  81.61 
 
 		 224 aa  387  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0664  two component transcriptional regulator  79.28 
 
 		 237 aa  371  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.16 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1559  response regulator receiver  37.05 
 
 		 228 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.2 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  35.91 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 228 aa  147  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  31.7 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1610  two component transcriptional regulator  36.53 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.496365  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  34.67 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  34.55 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5331  transcriptional regulator two components regulatory system  35 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0274603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.38 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3919  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 227 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 227 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  36.24 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1233  two component transcriptional regulator  35.91 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3997  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  34.39 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.55 
 
 		 223 aa  138  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4527  two component transcriptional regulator  35.91 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2880  two component transcriptional regulator  35.45 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  35.78 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 224 aa  138  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.68 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  35.45 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3856  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2192  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.36 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2084  DNA-binding heavy metal response regulator  36.36 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000771382  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  34.07 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2480  DNA-binding heavy metal response regulator  36.36 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000187636  normal  0.518539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.62 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  35.32 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.84 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  35.78 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02379  two-component response regulator transcription regulator protein  32.89 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.261012 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  35.78 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1433  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  34.67 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  31.96 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0097  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4240  two component transcriptional regulator  34.09 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.735778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.96 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.96 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  34.22 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  34.7 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.96 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  34.09 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  32.73 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  32.3 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  34.7 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1185  response regulator receiver  34.22 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  33.48 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 266 aa  131  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3610  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.87 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.82 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0723  transcriptional regulator, response regulator  35 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.87 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  33.78 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0253  DNA-binding response regulator PhoB  33.63 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3491  two component transcriptional regulator  35.45 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3426  DNA-binding transcriptional activator CusR  33.04 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  32.58 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.94 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.11 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.03 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.04 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  32.88 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.74 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  33.03 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0376  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.88 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.4 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  31.96 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>